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分枝杆菌靶向测序

在天津市河东区做分枝杆菌靶向测序,推荐东区万核医学基因检测咨询中心(攀枝花市东区攀枝花大道东段266号(如需办理,需提前预约)),电话4001789498。专业病原检测,助力感染性疾病精准诊疗。

预约价 ¥1680
¥2184
省¥504
报告时间:3-5个工作日
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检测项目详情

分枝杆菌靶向测序介绍

一、项目介绍

分枝杆菌靶向测序是一项基于多重PCR扩增与二代测序技术的病原感染精准检测项目,专门针对临床疑似分枝杆菌感染及需要耐药指导的病例。本项目通过一次性检测,可实现对结核分枝杆菌复合群、广泛非结核分枝杆菌以及麻风分枝杆菌的精准鉴定,并同步完成对一线及二线抗结核药物的相关耐药基因分析,为临床抗感染治疗提供快速、全面的分子依据。

中国感染性疾病现状与挑战

在天津市河东区做分枝杆菌靶向测序,推荐东区万核医学基因检测咨询中心提供专业的分枝杆菌靶向测序检测服务。预约电话:400-178-9498

感染性疾病在我国疾病负担中占据重要地位,精准诊断是有效治疗和控制的关键。

  • 结核病负担沉重:我国是全球结核病高负担国家之一,患者数量位居世界前列,防控形势严峻。
  • 医院感染不容忽视:重症监护病房(ICU)内医院获得性感染发生率较高,其中部分由耐药菌引起,增加了治疗难度和患者死亡率。
  • 耐药问题日益突出:结核分枝杆菌及非结核分枝杆菌的耐药菌株检出率呈上升趋势,传统经验性用药和培养药敏方法周期长,易延误精准治疗时机。
  • 社区获得性肺炎与脓毒症高发:社区获得性肺炎发病率持续处于较高水平,而脓毒症作为严重的感染并发症,其死亡率居高不下,快速明确病原体是改善预后的核心环节。

在此背景下,能够快速、广谱、精准识别病原体并预测其耐药性的检测技术,对于改善患者预后、遏制抗菌药物滥用、降低医疗负担具有至关重要的价值。

二、感染诊断决策路径

传统感染诊断路径步骤繁琐、耗时较长。分子诊断技术的引入,特别是靶向测序,优化了决策流程,缩短了确诊时间。

感染性疾病诊断与治疗决策优化路径

阶段 主要方法 特点与局限 转向靶向测序的时机与价值
初始经验治疗 基于症状、体征、影像学及常规检验的临床经验 响应迅速,但存在用药盲目性,易导致治疗失败或诱导耐药。 当经验性抗感染治疗无效、病情复杂或疑似特殊/耐药病原体时,需寻求分子诊断。
传统病原学检查 涂片镜检、培养(含药敏) 金标准,但周期长(数周)、阳性率低(尤其对于苛养菌、胞内菌如分枝杆菌)。 在等待培养结果期间,或培养阴性但临床高度怀疑感染时,作为快速补充与替代。
宏基因组测序 mNGS 无偏倚检测,覆盖范围广,但背景噪音高、对宿主核酸去除要求高、成本相对较高、耐药信息有限。 当怀疑新发、罕见病原体或传统方法阴性时使用。对于分枝杆菌等特定病原体群,其灵敏度可能低于靶向富集技术。
精准靶向治疗 分枝杆菌靶向测序等靶向技术 高灵敏度与特异性:通过特异性引物富集目标病原体核酸。
快速:报告周期短。
耐药信息全面:同步检测多种药物耐药相关基因。
性价比高:针对目标病原体群深度测序。
核心决策点:临床高度怀疑分枝杆菌感染;需要快速鉴别结核与非结核分枝杆菌;急需耐药信息指导用药调整;免疫抑制患者合并感染;抗结核治疗疗效监测。

三、病原体覆盖范围

本检测采用精心设计的引物 panel,实现对分枝杆菌属病原体的广泛覆盖与精细区分。

结核分枝杆菌复合群

涵盖7种成员,包括结核分枝杆菌(MTB)、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌等,精准鉴定至复合群及部分亚种水平。

非结核分枝杆菌

覆盖临床常见的66种以上NTM,如鸟分枝杆菌复合群(MAC)、堪萨斯分枝杆菌、脓肿分枝杆菌、偶然分枝杆菌等,助力鉴别诊断。

麻风分枝杆菌

特异性检测麻风分枝杆菌,为麻风病的分子诊断提供有力工具。

耐药基因谱

同步检测与一、二线抗结核药物相关的35个以上耐药基因突变位点,涵盖利福平、异烟肼、乙胺丁醇、氟喹诺酮类、注射类药物等,直接指导临床用药方案制定。

四、检测流程

  1. 样本采集与运送:根据感染部位,规范采集相应样本(详见送检须知),使用专用保存管,低温运输至检测实验室。
  2. 核酸提取与质控:对样本进行前处理,提取总核酸,并进行浓度与纯度质控。
  3. 多重PCR靶向富集:使用特异性引物池对分枝杆菌基因组特定区域及耐药基因位点进行多重PCR扩增,高效富集目标序列。
  4. 二代测序文库构建与上机:将扩增产物构建成适用于高通量测序的文库,在测序仪上进行深度测序。
  5. 生物信息学分析:对下机数据进行质控、比对、物种鉴定、耐药基因突变分析及结果解读。
  6. 报告出具:生成包含病原体检出情况、菌种鉴定结果、耐药基因突变解读及临床用药提示的详细报告。标准报告周期为收到合格样本后24-48小时

五、在抗感染监测中的应用价值

  • 快速确诊,指导精准治疗:显著缩短分枝杆菌鉴定和耐药检测时间,使患者尽早获得精准靶向治疗,避免无效或有害的广谱抗菌药物暴露。
  • 鉴别诊断关键工具:有效区分结核分枝杆菌与NTM感染,两者的治疗原则和方案截然不同,明确诊断对预后至关重要。
  • 监测治疗反应与复发:对于治疗过程中疗效不佳或疑似复发的患者,可通过本技术动态监测病原体载量变化及耐药谱演变,评估疗效并调整方案。
  • 流行病学调查与感染控制:高分辨率的分子分型信息(部分)可用于院内或社区感染的溯源分析,辅助感染控制措施的制定。
  • 服务特殊人群:对于儿童、免疫缺陷患者(如HIV感染者、器官移植术后)、肺部基础疾病患者等特殊人群,快速精准的诊断意义更为重大。

六、送检须知

适用样本类型:本检测支持多种来源的样本,包括但不限于:外周血、支气管肺泡灌洗液、痰液(诱导痰或晨痰)、脑脊液、尿液、胸水、腹水、关节液、粪便、新鲜组织等。具体采集要求请参照各样本类型的标准操作程序。

临床适应症建议

  • 疑似肺结核或肺外结核,但涂片或培养阴性,或需要快速确诊者。
  • 疑似非结核分枝杆菌感染,尤其是免疫抑制宿主或慢性肺部疾病患者。
  • 抗结核治疗失败或复发,需明确是否由耐药导致。
  • 需要启动抗结核治疗,但希望预先获得耐药信息以优化初始方案。
  • 不明原因发热、肺炎、中枢神经系统感染、淋巴结炎等,临床鉴别诊断需排除分枝杆菌感染。

注意事项:样本采集应尽可能在抗菌药物使用之前进行,若已用药需在申请单上注明。样本需使用无菌容器,并确保足量。运输过程中需保持低温,避免反复冻融。具体样本量、保存与运输细节,请咨询检测服务提供方。

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