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肿瘤全外显子组基因检测升级版-组织

昌黎县万核医学基因检测咨询中心提供秦皇岛市昌黎县肿瘤全外显子组基因检测升级版-组织服务,咨询热线4001789498。位于河北省秦皇岛市昌黎县昌黎镇三街27号(如需办理,需提前预约),权威实验室检测,报告准确可靠。

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肿瘤全外显子组基因检测升级版-组织专业介绍

肿瘤全外显子组基因检测升级版-组织专业介绍

引言:基于指南的精准医疗基石

根据美国国家综合癌症网络(NCCN)指南及中国临床肿瘤学会(CSCO)指南的最新推荐,全面的基因检测已成为多种实体瘤(如肺癌、结直肠癌、乳腺癌等)标准诊疗路径中不可或缺的一环。指南明确指出,对于晚期或转移性肿瘤患者,通过基因检测明确驱动基因突变状态,是指导靶向治疗、免疫治疗及判断预后的关键前提。本检测方案旨在提供最全面的基因组信息,为临床决策提供坚实的分子证据。

1. 项目介绍与癌种流行病学背景

肿瘤全外显子组基因检测升级版(组织)是基于下一代测序技术,对肿瘤组织样本进行全外显子组测序,并同步检测患者配对血液样本(白细胞)以区分胚系与体细胞突变的高通量检测产品。其核心价值在于一次性全面扫描与肿瘤发生发展、治疗反应及耐药机制相关的基因变异,为患者描绘完整的“基因画像”。

在中国,恶性肿瘤是严重威胁人民健康的重大疾病。以肺癌、胃癌、结直肠癌、肝癌、乳腺癌等常见癌种为例,根据中国国家癌症中心最新统计数据:中国恶性肿瘤年新发病例数约数百万人,总体发病率与死亡率仍处于较高水平。不同癌种的流行病学特征各异,例如,肺癌的发病率和死亡率均位居恶性肿瘤首位,男性发病率高于女性;胃癌、食管癌等上消化道肿瘤在中国发病率显著高于世界平均水平;结直肠癌发病率呈持续上升趋势;乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤。总体而言,中国恶性肿瘤的5年相对生存率在过去十年虽有显著提升,但仍与发达国家存在差距,这凸显了早诊早治和精准治疗的重要性。恶性肿瘤的高发年龄多在40岁以上,并随年龄增长而增加。推行规范化的基因检测,是实现生存率提升这一目标的关键技术手段之一。

2. 检测内容详解

本升级版检测全面覆盖肿瘤相关基因的外显子区域及部分内含子区域(如与融合、剪接相关的关键区域),检测内容远超常规热点检测Panel。其主要分析范畴包括:

基因类别/变异类型 检测内容 临床意义(靶向药/适应症/预后) 证据等级
靶向治疗相关基因 点突变、小片段插入缺失、拷贝数变异、基因融合 匹配已上市的靶向药物(如EGFR TKI, ALK/ROS1抑制剂, PARP抑制剂等)及对应癌种适应症 NCCN/CSCO指南I-III级推荐
免疫治疗相关生物标志物 TMB(肿瘤突变负荷)计算, MSI(微卫星不稳定性)状态评估 预测PD-1/PD-L1抑制剂疗效,指导免疫治疗 NCCN/CSCO指南I-II级推荐
遗传风险评估基因 胚系致病/可能致病性变异 评估遗传性肿瘤风险(如BRCA1/2, APC, MLH1等),指导家族风险管理 临床诊断级
预后及耐药监测相关 特定耐药突变(如EGFR T790M, KRAS G12C等),通路激活状态 评估疾病进展风险,揭示耐药机制,指导后续治疗方案选择 临床研究级至指南推荐级
临床试验匹配 广泛基因变异 为无标准治疗方案或标准方案失败的患者匹配潜在的新药临床试验 探索性

3. 检测技术原理

本检测采用基于NGS的成熟技术流程,确保数据的准确性与可靠性:

  • 样本制备与建库:从福尔马林固定石蜡包埋组织切片中提取肿瘤DNA,同时从外周血中提取白细胞DNA作为对照。对DNA进行片段化、末端修复、加接头等步骤,构建测序文库。
  • 目标区域捕获与富集:使用特异性探针对人类全外显子组区域(约30Mb)进行高效杂交捕获,富集目标序列。
  • 高通量测序:在主流的高通量测序平台上进行双末端测序,确保每个目标区域达到足够的测序深度(通常平均深度≥500×),以准确检测低频突变。
  • 生物信息学分析:将测序产生的海量数据与人类参考基因组进行比对,通过专业算法识别体细胞突变(与血液对照比较)、拷贝数变异、基因融合等。进行TMB、MSI等高级分析,并注释变异的临床意义。

4. 适用人群

本检测适用于以下五类临床场景,帮助医生和患者做出更合理的检测选择:

  • 初诊分型与一线治疗指导:尤其是病理类型特殊、罕见或晚期、转移性的实体瘤患者,需要全面寻找可用靶点,制定最佳初始治疗方案。
  • 耐药换药与后线治疗探索:接受标准靶向或化疗后出现疾病进展的患者,需明确耐药机制,寻找后续靶向、免疫或联合治疗机会。
  • 术后监测与复发风险评估:通过检测手术组织样本,评估分子层面的复发风险,并为未来可能的复发储备全面的分子信息。
  • 遗传风险评估:对于有肿瘤家族史、早发、多原发或罕见肿瘤患者,需评估是否存在遗传性肿瘤综合征的风险。
  • 高风险人群筛查与辅助诊断:在特定临床背景下,辅助难以确诊的肿瘤进行分子分型。

与仅覆盖数十至数百个基因的热点Panel相比,全外显子组检测在发现罕见突变、未知驱动基因、全面评估TMB及探索性研究方面具有不可替代的优势,尤其适用于后线治疗、疑难病例及寻求临床试验机会的患者。而热点Panel则以其经济、快速、针对性强等特点,更适用于一线已知常见驱动基因的快速筛查。临床医生可根据患者的具体病情阶段、经济状况及治疗目标进行合理选择。

5. 检测流程

标准化的检测流程是保证结果准确和及时的基础:

  • 第一步:临床医嘱与知情同意:临床医师根据患者病情开具检测申请,并与患者充分沟通检测的目的、意义及局限性,签署知情同意书。
  • 第二步:样本采集与处理:采集肿瘤组织样本(如手术或活检样本,需经病理评估确认肿瘤细胞含量)和配对的外周血样本(用于白细胞DNA提取)。样本按要求保存并及时转运。
  • 第三步:样本送检与登记:样本连同完整的申请单被送至检测实验室,进行唯一编号登记和信息核对。
  • 第四步:实验室检测与数据分析:在符合资质的临床实验室内,严格按前述技术流程完成湿实验和生物信息学分析。
  • 第五步:报告生成与交付:检测完成后,约7个工作日内生成结构化电子及纸质报告,经审核后交付给申请医师。报告包含检测结果摘要、详细变异列表、临床解读与用药建议等。

6. 预防与监测策略

基于全外显子组检测的结果,可以制定个体化的术后随访和监测策略:

  • 术后规律随访:根据原发癌种、分期及分子风险特征(如特定高危突变),制定个体化的影像学(如CT、MRI)和肿瘤标志物复查频率,通常术后2年内每3-6个月一次,之后逐渐延长间隔。
  • ctDNA动态监测:对于已完成组织全外显子检测的患者,可利用其检测出的个体化突变谱,定制ctDNA监测Panel,通过定期抽血监测循环肿瘤DNA,实现无创的疗效评估、微小残留病灶监测及早期复发预警。
  • MRD评估:在根治性治疗(如手术)后,通过高灵敏度的ctDNA检测评估分子层面的微小残留病灶状态,其阳性结果通常提示更高的复发风险,可能需要考虑辅助治疗或加强监测。

7. 报告解读要点

一份全面的基因检测报告是连接检测结果与临床实践的桥梁,解读需关注:

  • 突变分类与临床意义:报告会将检出的变异根据其致病性证据分为“致病/可能致病”、“临床意义不明”、“可能良性/良性”。临床重点关注具有明确或潜在治疗意义的变异。
  • 个体化用药建议:报告会列出与检出变异相关的已获批靶向/免疫药物(标注适应症癌种及国内外获批状态)、化疗药物敏感性/耐药性证据,以及潜在的联合治疗策略。
  • 临床试验匹配:对于缺乏标准治疗选项的患者,报告可能提供与其特定基因变异匹配的正在招募的临床试验信息,为患者提供新的治疗希望。
  • 遗传咨询建议:若发现胚系致病性变异,报告会明确提示,并建议患者进行遗传咨询,对其家族成员的风险管理提供指导。

最终的治疗决策,必须由临床医生结合患者的整体身体状况、既往治疗史、病理报告、影像学评估以及基因检测报告,进行综合判断后做出。

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