分枝杆菌靶向测序
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分枝杆菌靶向测序
所属分类：病原感染检测 / 产品子类：靶向测序项目
检测方法：多重PCR+二代测序
报告周期：24-48小时
项目介绍
分枝杆菌靶向测序是一项基于多重PCR扩增与二代测序技术的高灵敏度、高特异性检测项目。它针对临床常见的各类样本（如外周血、支气管灌洗液、痰液、脑脊液、尿液、胸腹水、关节液、粪便及新鲜组织等）中的分枝杆菌核酸进行精准捕获与测序分析。
本检测的核心价值在于其“一测双察”能力：一方面，它能一次性鉴定包含结核分枝杆菌复合群7种、非结核分枝杆菌66种以及麻风分枝杆菌在内的广泛分枝杆菌种类；另一方面，它同步对与抗结核治疗相关的35个一、二线药物耐药基因进行检测，从而为临床提供从病原鉴定到用药指导的完整解决方案，助力实现精准抗感染治疗。
中国感染性疾病现状与挑战
大连市万核医学基因检测咨询中心提供专业的分枝杆菌靶向测序检测服务。预约电话：400-178-9498
感染性疾病的精准诊断在中国面临严峻挑战，相关流行病学数据凸显了本检测的紧迫性与必要性：
- 结核病负担沉重：中国是全球结核病高负担国家之一，患者数量位居全球第三。结核分枝杆菌感染依然是严重的公共卫生问题。
- 医院感染形势严峻：重症监护病房（ICU）内医院获得性感染的发生率高达15-30%，其中耐药菌感染是导致治疗失败和患者死亡的重要原因。
- 耐药问题日益突出：临床分离的病原菌中，耐药菌株的检出率呈持续增长趋势，尤其是耐多药结核病（MDR-TB）和广泛耐药结核病（XDR-TB）的威胁日益增大。
- 社区感染发病率高：社区获得性肺炎等感染性疾病发病率居高不下，病原体构成复杂，早期明确诊断困难。
- 脓毒症死亡率高：脓毒症及脓毒性休克患者死亡率高，快速、准确地识别致病病原体及耐药信息是改善预后的关键。
在此背景下，传统微生物培养耗时长、阳性率低，而宏基因组测序（mNGS）成本较高且报告解读复杂。分枝杆菌靶向测序以其快速、精准、经济的特点，成为填补传统方法与mNGS之间空白的重要工具，尤其适用于疑似分枝杆菌感染、疗效不佳或需快速明确耐药情况的患者。
感染诊断决策路径
面对疑似感染患者，尤其是重症、复杂或疗效不佳者，合理的诊断决策路径对于改善预后至关重要。分枝杆菌靶向测序在以下路径中扮演关键角色：
如图所示，当临床怀疑分枝杆菌感染，尤其是患者病情复杂、传统培养阴性或疗效不佳时，分枝杆菌靶向测序可作为连接“初步诊断”与“精准用药”的桥梁，快速提供决策依据，避免因等待传统药敏结果而延误治疗。
病原覆盖范围
本检测采用精心设计的引物 panel，实现了对临床相关分枝杆菌的广泛覆盖，并兼顾了关键的耐药基因检测。
分枝杆菌靶向测序覆盖谱
一、 病原体鉴定覆盖（总计74种）：
- 结核分枝杆菌复合群（7种）： 涵盖结核分枝杆菌、牛分枝杆菌、非洲分枝杆菌等所有重要成员。
- 非结核分枝杆菌（66种）： 全面覆盖临床常见的快速生长型（如脓肿分枝杆菌、偶发分枝杆菌）、缓慢生长型（如鸟分枝杆菌复合群、堪萨斯分枝杆菌）以及其它罕见非结核分枝杆菌。
- 麻风分枝杆菌（1种）： 实现对麻风病病原体的分子鉴定。
二、 耐药基因检测覆盖（35个基因位点）：
- 一线药物耐药基因： 覆盖利福平（rpoB）、异烟肼（katG, inhA等）、乙胺丁醇（embB）、吡嗪酰胺（pncA）等相关的关键突变。
- 二线药物耐药基因： 覆盖氟喹诺酮类（gyrA, gyrB）、氨基糖苷类/环肽类（rrs, eis）、乙硫异烟胺（ethA, inhA）等药物的耐药相关基因。
- 其他： 同时检测与贝达喹啉、利奈唑胺等新型或二线药物相关的潜在耐药位点。
注：本检测专注于分枝杆菌及其耐药基因，与覆盖细菌、病毒、真菌、寄生虫的广谱病原检测方法（如mNGS）形成互补。当临床高度怀疑分枝杆菌感染时，本检测提供更具深度和成本效益的解决方案。
检测流程
- 样本采集与运送： 根据感染部位，规范采集相应样本（如痰液、支气管灌洗液、胸水、组织等），使用专用采样管保存，并尽快低温运送至检测实验室。
- 核酸提取与质控： 对样本进行前处理，提取总核酸，并进行浓度与纯度质控，确保下游检测有效性。
- 多重PCR扩增： 使用特异性引物对分枝杆菌基因组靶向区域及耐药基因区域进行多重PCR扩增，富集目标序列。
- 二代测序文库构建与上机： 对PCR产物进行纯化、加接头，构建测序文库，在二代测序平台上进行高通量测序。
- 生物信息学分析： 对测序数据进行质控、比对、去重，通过与专属数据库比对，鉴定分枝杆菌种属并分析耐药基因突变情况。
- 报告出具： 综合生物信息分析结果与临床信息，在24-48小时内出具包含病原体鉴定结果、耐药基因突变解读及临床用药建议的详细报告。
在抗感染监测中的应用价值
- 早期快速诊断： 显著缩短分枝杆菌感染的诊断时间，尤其适用于培养周期长或培养阴性的病例，如播散性结核、结核性脑膜炎等。
- 耐药情况快速研判： 在获得培养药敏结果前，提前数周提供分子药敏信息，为初始治疗方案调整或耐药结核病治疗方案的制定赢得宝贵时间。
- 疗效监测与复发判断： 治疗过程中，可通过动态检测监测病原体载量变化及耐药基因的演变，辅助评估疗效、判断复发或再感染。
- 感染控制与流行病学调查： 高分辨率的基因分型信息有助于医院内或社区内分枝杆菌感染暴发的溯源与传播链分析。
- 指导个体化精准治疗： 综合病原鉴定与耐药信息，帮助临床医生选择最有效的药物组合，实现“因病施治，因人施药”，避免无效治疗，减少药物不良反应。
送检须知
适用人群：
- 疑似结核病或非结核分枝杆菌感染，但临床表现、影像学不典型，或传统检测阴性的患者。
- 抗结核治疗疗效不佳，需快速明确是否存在耐药的患者。
- 免疫抑制患者（如HIV感染者、器官移植后、长期使用免疫抑制剂）出现不明原因发热或感染症状，需排查分枝杆菌感染者。
- 需要与其它病原体感染进行鉴别诊断的肺炎、脑膜炎、淋巴结炎、皮肤软组织感染等患者。
样本要求：
- 请根据疑似感染部位选择最合适的样本类型（如肺部感染优先支气管灌洗液或深部痰；中枢神经系统感染选择脑脊液）。
- 样本应尽可能在抗菌药物使用前采集。若已用药，需在申请单上注明。
- 严格无菌操作，避免污染。使用实验室提供的专用无菌容器或核酸保存管。
- 样本量需满足检测要求。具体最低样本量要求请参照各样本类型的采样指南。
报告解读：
- 本检测结果为分子生物学证据，需结合患者的临床表现、影像学、其它实验室检查结果由临床医生综合判断。
- 耐药基因检测提示的“突变”需根据已知的基因型-表型关联数据库进行解读，其临床意义应由感染科或呼吸科专家评估。
- 阴性结果不能完全排除感染，可能与样本中病原体载量过低、核酸降解或采样不当有关。
分枝杆菌靶向测序技术将分子诊断的快速性与靶向检测的精准性相结合，为应对中国严峻的分枝杆菌感染与耐药挑战提供了有力的新型武器，是推动感染性疾病精准诊疗模式发展的重要一环。
