病原微生物宏基因组检测（DNA+RNA）
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一、精准诊断体的重要性：应对严峻的感染挑战
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，感染依然是威胁人类健康的主要因素之一。在中国，感染尤为沉重。数据显示，中国的结核数量第三，结核作为一种细菌感染，精准诊断与耐药性判定是治疗成功。在医疗机构，重症监护（ICU）的医院感染发生率高达15%至30%，这些感染往往由多重耐药菌引起，导致住院时间延长、医疗费用激增及死亡率上升。与此同时，细菌耐药形势严峻，临床分离菌株中的耐药菌检出率持续增长，使得传统经验性抗感染治疗面临巨大挑战。
社区获得性肺炎作为常见的感染，不下，体构成复杂，从细菌、到非体均有可能。更为危急的是脓毒症，凶险、进展，死亡率高，早期明确体并针对性用药是改善预后的决定性步骤。然而，传统的体检测方法如、涂片等，存在检出率低、周期长、覆盖范围窄等局限，难以满足危重、疑难及新发突发传染快速精准诊断需求。因此，发展一种能够、快速、精准识别体的检测技术，对于提升感染诊疗水平、遏制抗菌药物滥用、改善预后重要的意义。
二、体检测方案对比分析
随着分子生物学技术的发展，体诊断方法不断演进。下表对比了四种主要检测技术的核心特点：
通过对比可见，微生物宏基因组检测（mNGS）在检测范围的广度、新体的发现能力以及耐药毒力信息的同步获取方面，革命性优势，有效弥补了传统方法的不足。
三、微生物宏基因组检测（DNA+RNA）的核心优势
该技术整合了DNA与RNA测序，实现了对体生命活动遗传物质的捕获，核心优势体现在：
- 无偏倚的广谱检测： 不依赖于与预设引物，能够一次性检测样本中细菌、（DNA与RNA）、真菌、寄生虫31033种微生物，极大提升了体的检出率，适用于传统方法阴性的疑难感染。
- 直接检测RNA： 通过提取并逆转录RNA，能够直接检测流感、、诺如等含有RNA基因组的，对于呼吸道、消化道感染的诊断。
- 同步解析耐药与毒力： 在鉴定体的同时，可检测4417种抗性基因和484种毒力基因，为临床评估菌株耐药潜力和性强弱提供分子依据，制定更精准的抗感染策略。
- 快速高效： 报告周期通常为24至48小时，远快于传统，能为脓毒症、脑膜炎、重症肺炎等急危重症感染争取宝贵的治疗时间。
- 样本类型灵活： 适用于静脉血、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、水、积液、拭子、实体组织、粪便等多种临床样本，满足不同部位感染的检测需求。
四、主要临床应用场景
基于技术优势，微生物宏基因组检测在以下临床场景中价值显著：
- 危重症与疑难感染： 如原因不明的发热、脓毒症/脓毒症、重症肺炎、中枢神经系统感染等，在常规检查无法明确时，可作为重要诊断。
- 抑制宿主感染： 对于肿瘤、移植、长期使用抑制剂等低下，感染体复杂、机会菌多，广谱检测有助于早期发现混合感染或罕见体。
- 新发突发溯源与诊断： 面对未知体引起的聚集性或突发性，该技术能够快速识别，为响应提供信息。
- 抗感染治疗指导与优化： 通过鉴定体携带的耐药基因，帮助临床由经验性治疗转向靶向治疗，广谱抗菌药物的不当使用，延缓耐药产生。
- 或反复发作感染： 如肺部感染、等，用于探寻潜在的、不易的体。
五、在感染预防与监测中的潜在价值
个体诊疗，该技术在医院感染防控和学监测中亦潜力。通过对ICU环境、医疗器械或感染暴发事件的样本进行宏基因组测序，可以快速追踪感染源和传播链，识别医院定植或流行的多重耐药菌，为制定精准的感染控制措施提供数据支持。在区域乃至层面，持续监测体谱和耐药基因的变迁，可为抗菌药物管理策略和防控政策的制定提供科学依据，从宏观上应对耐药增长和暴发的挑战。
、检测须知
为确保检测结果的准确性与临床实用性，送检时需注意：
- 合理选择送检样本： 应采集疑似感染部位的样本（如肺炎取肺泡灌洗液，中枢感染取脑脊液）。对于血流感染或性感染，可考虑采集血液样本。样本质量直接影响检测灵敏度。
- 规范采集与运输： 使用无菌容器，严格无菌操作环境或皮肤菌群污染。样本采集后应尽快按要求保存并运送至实验室，RNA样本需注意低温保存以防降解。
- 结合临床信息解读： 检测结果需由临床医生结合、症状、体征实验室检查进行综合判读。报告中检出的微生物需区分是菌、定植菌还是背景菌，序列数，不能简单等同于体负荷或活动性感染。
- 理解技术局限性： 该技术高度依赖数据库的完整性与准确性，对于数据库未收录的极新或罕见体，可能无法鉴定。此外，检测敏感性受样本中体量、人源背景等因素影响。
综上所述，微生物宏基因组检测（DNA+RNA）、快速、精准的特点，正在重塑感染性诊断模式，成为应对复杂感染、危重症救治及新发防控的强大，为提升水平贡献重要力量。
