全外显子测序分析/纳昂达-10G(家系)
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一、项目介绍:应对出生缺陷的精准遗传学利器
出生缺陷是影响我国人口素质的重大问题。学数据显示,中国出生缺陷发生率约为5.6%,这意味着每年新增的出生缺陷患儿接近100万例。,遗传因素在出生缺陷的中占据重要地位。常见的染色体如唐氏综合征,在活产新生儿中的发生率约为1/600至1/800。此外,大量单基因遗传虽然单一种不高,但种类繁多,总体携带频率不容忽视。随着生育年龄的推迟,高龄孕产妇比例逐年上升,进一步增加了胎儿罹患染色体非整倍体及某些单基因风险。在此背景下,精准、高效的产前遗传学诊断技术对于预防出生缺陷、实现优生优育。
“外显子测序分析/纳昂达-10G(家系)”正是一款基于二代测序技术的高端优生遗传检测产品。它通过对核心家系(通常证父母)进行外显子组测序,系统性地分析可能与表型基因变异,旨在临床医生对疑似遗传,特别是临床表现复杂、难以明确指向某一种特定患儿或胎儿,进行分子层面的诊断与鉴别诊断,为后续的临床决策、家系遗传咨询及再生育指导提供的科学依据。
二、检测详解
本检测项目采用的高深度二代测序技术,对约20,000个人类基因的外显子区域毗邻剪接区域进行测序与分析。核心优势在于不设定范围,能够一次性筛查 vast 范围的单基因遗传,常染色体显性、常染色体隐性、X连锁遗传等多种遗传模式下的。
| 项目 | 覆盖范畴 | 理论检出率 | 技术性能 |
|---|---|---|---|
| 外显子组测序(家系Trio) | 覆盖已知的数千种单基因遗传,涉及神经系统、心血管系统、代谢系统、骨骼系统、五官、皮肤等多个系统。适用于临床诊断不明、表型复杂或疑似为罕见遗传。 | 对由外显子区点突变及小片段缺失导致的单基因,检出率可达95%以上。对于动态突变、大片段缺失/重复及深度子区域变异,本方法可能存在局限。 | 采用高深度测序(平均深度≥100X),有效降低假阳性率。结合家系分析,可显著提高变异性判读的准确性,并区分新生突变与遗传性突变。 |
请注意:外显子测序是一项筛查与诊断相结合的技术。阴性结果不能排除遗传可能,阳性结果需结合表型、家系信息检查结果由临床遗传专家进行综合解读。
三、检测技术原理与流程
检测流程严格遵循临床实验室标准,确保结果的准确性与可靠性,主要分为以下五个步骤:
- 样本采集与处理:支持多种样本类型,孕妇外周血(提取胎儿游离DNA需特殊管型)、新生儿或儿童外周血、干血片、拭子或已提取的基因组DNA。样本经专业采集后,低温运输至实验室。
- 文库构建与测序:对样本DNA进行片段化、末端修复、加接头等步骤,构建高通量测序文库。随后在成熟的二代测序平台上进行双末端测序,确保数据质量。
- 生物信息学分析:下机数据经过质控、比对到人类参考基因组。通过专业算法识别单核苷变异和小片段缺失。此步骤是数据转化的核心。
- 变异注释与筛选:将识别出的变异与多个权威数据库、人群频率数据库进行比对,并根据ACMG(美国医学遗传学与基因组学学会)指南进行性分级。家系分析模式能有效过滤大量多态性位点,聚焦于致异。
- 报告生成与审核:由临床遗传学专家和生物信息学专家对筛选出的候选变异进行人工复核,结合送检临床信息进行最终解读,生成结构化、易于理解的临床检测报告。
四、适用人群
本检测主要适用于有以下个体或家庭,以寻求遗传学诊断:
- 高龄孕妇:预产期年龄达到或35周岁的孕妇,胎儿染色体异常风险增高,同时也是某些新发单基因突变的高风险人群。
- 产前筛查异常:学唐氏筛查或无创产前检测提示高风险,或发现某些特定生化指标异常。
- 胎儿结构异常:孕期检查发现胎儿存在单一或多发结构畸形(如心脏畸形、神经系统异常、骨骼发育异常等),无法用常见非整倍体解释时。
- 不良孕产史:有反复流产、死胎、死产或新生儿死亡史的夫妇。
- 遗传家族史或疑似患儿:家族中有明确或疑似遗传;已出生儿童存在生长发育迟缓、智力障碍、特殊面容、多发畸形或代谢异常等,临床诊断不明。
五、最佳检测时机与流程
最佳时机:对于产前诊断,通常在孕周达到并规定孕周(需依据临床指南及羊膜穿刺/绒毛膜穿刺的可行时间)且发现异常后尽快进行。对于产后诊断,任何年龄均可进行,越早明确诊断越有利于管理与干预。
标准流程:
- 临床评估与申请:由产前诊断科或临床科室医生进行专业评估,确认有检测指征,签署同意书。
- 样本采集:根据采集证父母的样本(家系Trio模式为最佳),按要求保存与寄送。
- 实验室检测:实验室收到合格样本后,启动检测流程。
- 报告周期:自实验室收到所有合格样本之日起,常规报告周期为8-12个工作日。复杂可能需时更长。
- 报告交付与解读:报告后,由申请医生获取并负责向受检解读。
、孕期监测与遗传咨询
外显子测序是遗传诊断链条中的一环,整合到临床管理中。
- 结果随访:检测完成后,无论结果阳性或阴性,均建议进行专业的遗传咨询。阳性结果需明确该变异对胎儿或患儿健康影响、预后、治疗及管理方案。
- 多学科协作:根据检测发现的类型,可能需要转介至相应的专科(如小儿心脏科、神经科、代谢科等)进行进一步的评估与随访。
- 再生育指导:对于确诊遗传家庭,遗传咨询师可提供详细的再生育风险评估,介绍产前诊断或胚胎前遗传学检测等选择,为家庭规划未来生育提供支持。
- 数据保存与再分析:随着医学研究的进展,新的基因不断被发现。对于当前阴性的,可应临床要求或在未来特定,对原始数据进行重新分析。
七、临床报告解读要点
临床报告将变异分为以下几类,解读需格外:
- 阳性结果(性/可能性变异):报告中发现与受检表型高度或可能致异。此结果为临床诊断提供了强有力的分子证据,但需注意外显率或表型可变性可能。结合临床表现进行最终诊断。
- 阴性结果:未发现与当前表型明确致异。这可能是由于:1)不在外显子测序检测(如非遗传因素、表观遗传、大片段结构变异等);2)基因尚未被科学界认知;3)现有技术对某些复杂变异(如嵌合体)检测灵敏度有限。因此,阴性结果不能排除单基因遗传可能。
- 意义不明确变异:报告可能一些临床意义不确定的变异。这类变异目前证据不足,无法归类为或良性。对于VUS,通常不建议作为临床决策的主要依据,但需记录在案,并未来研究进展。有时可通过家系分离分析或进一步的功能实验来明确意义。
- 意外发现或次要发现:根据检测策略和同意选择,有时可能报告与本次检测指征,但重要临床意义的遗传变异(如某些成年期的遗传性肿瘤或心血管易感基因)。这类发现的告知需遵循严格的伦理指南和流程。
总之,“外显子测序分析/纳昂达-10G(家系)”是一项强大的遗传诊断,应用建立在临床评估、规范的检测流程和专业的遗传咨询基础之上,最终使家庭获益。