肿瘤全外显子测序(组织)
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精准决策的基石:一例肺癌诊疗启示
颍泉区万核医学基因检测咨询中心提供专业的肿瘤全外显子测序(组织)检测服务。预约电话:400-178-9498
52岁的王因持续咳嗽、胸痛就诊,CT检查发现右肺占位,初步诊断为非小细胞肺癌。面对这一诊断,王和主治医生面临着一系列问题:肿瘤的驱动基因是什么?有哪些靶向或治疗机会?手术后的复发风险如何评估?为了回答这些问题,医生建议王进行肿瘤组织外显子组测序,以期获得一份指导管理的“基因地图”。在中国,肺癌是率和死亡率均首位的恶性肿瘤。根据中国国家癌症中心最新数据,中国肺癌年新例数约82.8万,死亡数约65.7万,5年生存率19.7%。高发年龄在50-75岁之间,男性显著高于女性,男女比例约为2:1。这种严峻的学现状,使得像王这样的,亟需借助精准的分子诊断技术来寻找最佳治疗路径。
项目介绍
肿瘤外显子测序(组织)是基于下一代测序技术,对肿瘤组织样本中约2万个基因外显子区域进行的高通量测序。它如同一张高分辨率的扫描,覆盖了当前与肿瘤诊疗密切核心基因,还囊括了外显子背景,为发现罕见突变和探索未知生物标志物提供了可能。相较于检测数十至数百个基因的Panel测序,外显子测序在基因覆盖广度上显著优势,适用于寻求靶向及治疗机会、评估遗传风险或探索性研究的。检测结果能为肿瘤的分子分型、靶向//化疗用药指导、预后评估以及遗传性肿瘤综合征筛查提供一站式、系统性的解决方案。
检测详解
本检测通过对肿瘤组织进行深度测序,系统性地解析以下信息:
检测技术原理
肿瘤外显子测序是一项复杂而精密的技术流程,主要步骤:
- 样本制备与建库:从石蜡切片或新鲜组织等样本中提取肿瘤基因组DNA,片段化并连接特异性的测序接头,构建测序文库。
- 外显子区域捕获:使用探针文库与建库后的DNA进行杂交,特异性富集人类基因组中约2万个基因的外显子区域,从而高效聚焦于蛋白编码序列。
- 高通量测序:将捕获后的文库在高通量测序仪上进行双端测序,产生海量的序列读数。
- 生物信息学分析:将测序数据与人类参考基因组进行比对,识别肿瘤组织中的体细胞突变(SNV、Indel、CNV、Fusion)和胚系突变,并计算TMB、MSI、HRD等基因组特征指标。通过专业的变异注释和数据库比对,最终生成临床可解读的报告。
适用人群
该检测适用于多类肿瘤临床场景,帮助实现个体化医疗:
- 初诊晚期或疑难分型:寻求最靶向和治疗机会,为一线治疗方案的制定提供分子依据。
- 标准治疗耐药或进展:探索耐药机制和后续潜在的治疗靶点,为换药或参与临床试验提供线索。
- 根治性术后:通过检测手术组织,建立个体化的突变图谱,为后续微小残留监测提供基线“指纹”。
- 有肿瘤家族史或个人史:同步分析胚系突变,评估遗传性肿瘤综合征风险。
- 部分高发癌种筛查后需确诊:在特定,进行分子层面的诊断与鉴别诊断。
检测流程
从临床决策到获取报告,流程规范:
- 临床医嘱:临床医生根据评估,检测申请单。
- 样本采集:由科或临床科室按规范采集石蜡埋组织块、切片、新鲜组织或穿刺活检组织。
- 样本寄送:样本在低温条件下转运至检测实验室。
- 实验室检测:实验室接收样本后,完成上述建库、捕获、测序及生信分析流程。
- 报告:检测完成后约15个工作日,详细突变信息、用药建议和临床解读的正式报告。
预防与监测
对于接受根治性手术,外显子测序的结果是开启精准术后管理的大门。基于检测建立的个体化突变图谱,医生可以:
- 制定个性化随访方案:根据原发肿瘤的分子特征和复发风险,制定影像学等常规随访的频率和。
- 指导ctDNA监测:利用测序结果筛选出特异性的体细胞突变作为分子标签,通过定期采集外周血进行循环肿瘤DNA高灵敏度检测,实现微小残留的动态监测。
- 评估MRD状态:术后ctDNA检测结果可用于评估MRD状态,阳性提示分子层面存在残留,复发风险显著增高,可能提示需要治疗或更密切的随访;持续阴性则提示预后良好。这种“分子复发”的预警往往早于影像学发现,为临床干预提供了宝贵的时间窗。
报告解读
一份专业的检测报告是连接复杂数据与临床实践的桥梁。报告通常:
- 突变分类与解读:将检出的变异根据临床意义分为性、可能性、意义不明、可能良性、良性等类别,并详细说明蛋白功能及肿瘤发生发展的影响。
- 用药建议:系统列出与检出突变靶向药物、治疗及化疗药物,并明确标注(如FDA、NMPA)的获批状态,以及在权威指南(如NCCN、CSCO)中的推荐等级,为医生用药决策提供直接参考。
- 临床试验:对于暂无标准治疗或标准治疗失败,报告可能提供分子特征的正在招募的临床试验信息,为提供新的治疗希望。
- 遗传咨询建议:若检出明确的胚系突变,报告会给出遗传风险评估,并建议家属进行遗传咨询。
综上所述,肿瘤组织外显子测序是肿瘤精准医疗体系中的核心之一。它通过一次性检测,为在整个诊疗周期中的决策提供分子层面的核心依据,从诊断分型、治疗选择到预后监测,助力实现真正的个体化管理。
