侵袭性真菌靶向测序
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一、精准诊断体的重要性:直面中国感染诊疗的严峻挑战
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侵袭性真菌感染(IFI)是临床诊疗中的重大挑战,起隐匿、进展、致死率高,抑制、重症及大手术后中威胁巨大。在中国,感染沉重,精准诊断的需求尤为迫切。数据显示,中国结核高国家之一,数量世界前列;重症监护(ICU)的医院感染发生率高达15%-30%,真菌感染是重要组成部分;细菌与真菌的耐药菌检出率持续增长,给传统经验性治疗带来巨大压力;社区获得性肺炎不下,脓毒症死亡率更是严重威胁生命。在此背景下,快速、准确地明确体,难以的侵袭性真菌,成为打破诊疗瓶颈、改善预后的。传统的诊断方法如,耗时长、阳性率低,往往导致诊断延迟,错过最佳治疗窗口。因此,如侵袭性真菌靶向测序这类高灵敏度、高特异性的分子诊断技术,对于实现感染性精准防控与个体化治疗重要的意义。
二、侵袭性真菌诊断方案对比分析
目前,临床用于侵袭性真菌诊断的主要方法传统、特定PCR、宏基因组测序(mNGS)以及靶向测序。下表从多个维度对这四种主流技术进行了系统对比:
三、侵袭性真菌靶向测序的核心优势
基于多重PCR结合二代测序技术,侵袭性真菌靶向测序在真菌感染诊断领域展现出独特优势:
- 精准靶向与高灵敏度: 通过特异性引物池对76种临床常见的侵袭性真菌(如念珠菌、曲霉、隐球菌、毛霉、耶氏肺孢子菌等)的保守基因区域进行多重PCR富集,极大提高了目标的浓度,从而实现对痕量真菌的高灵敏度检测,适用于血液等低载量样本。
- 高特异性与明确解读: 检测范围明确限定于性真菌,有效环境真菌或定植菌的干扰,结果临床指向性强,极大减轻了医生解读,更利于直接指导抗真菌治疗。
- 快速高效: 报告周期缩短至24-48小时,远快于传统,能够为危重抢得宝贵的治疗时间。
- 覆盖且经济高效: 一次性覆盖比传统和单重PCR更广泛的真菌谱,且相较于广谱的mNGS,靶向策略降低了测序数据量与分析成本,在保证精准度的同时提升了检测的经济性。
- 耐药监测: 部分靶向测序方案可同时检测与耐药基因突变,为临床评估耐药风险提供分子依据。
四、主要临床应用场景
该技术适用于多种存在侵袭性真菌感染风险的临床:
- 发热查与粒细胞缺乏伴发热: 对于血液肿瘤、造血干细胞移植后等严重抑制,当出现不明原因发热时,可快速从外周血中鉴定是否存在侵袭性真菌感染。
- 深部器官疑似真菌感染: 如疑似真菌性肺炎(肺泡灌洗液、痰液)、中枢神经系统感染(脑脊液)、真菌性败血症(血液)、感染(水)、泌尿系统感染(尿液)及骨感染(液、骨髓)等。
- 危重症感染鉴别: 在ICU中,对于重症肺炎、脓毒症/脓毒性,当常规抗细菌治疗无效或急剧恶化时,需快速排除或确认合并侵袭性真菌感染。
- 传统检测阴性但临床高度怀疑: 临床表现或影像学特征(如晕轮征、新月征),但学标志物(如G试验、GM试验)或传统结果阴性或滞后时,可作为重要的确诊。
- 疗效评估与复发监测: 对于已确诊并开始抗真菌治疗,动态监测体载量的变化,可评估治疗效果及预警复发。
五、在感染预防与控制中的价值
侵袭性真菌靶向测序服务于个体诊疗,也对医院感染预防与控制(IPC)和监测积极意义。通过快速准确地识别感染暴发中的体种类,能够及时追踪感染源和传播途径,指导实施有效的隔离与消毒措施。同时,持续监测临床分离真菌的种群分布变化,可为地区或医疗机构真菌感染的学特征提供数据,预警罕见或耐药真菌的出现,从而指导经验性治疗方案的优化和抗真菌药物的合理储备,从整体上降低ICU院感率和死亡率。
、检测须知
- 样本类型: 本检测适用于多种样本,外周血、肺泡灌洗液、痰液、脑脊液、尿液、胸水、水、液、骨髓、新鲜组织以及脓肿穿刺液等。样本采集量、容器及运输条件请检测机构提供的指南执行。
- 送检指征: 建议在临床高度怀疑侵袭性真菌感染,且需快速明确时送检。它是对传统微生物学检查的重要,而非替代。
- 结果解读: 检测结果为分子生物学证据,需由临床医生结合、症状、体征、影像学实验室检查结果进行综合判断,区分活动性感染、定植或死菌残留。
- 技术局限性: 本检测针对预选的76种侵袭性真菌靶标,无法检测此范围外的真菌、细菌、体。阴性结果不能排除真菌感染,靶标外真菌或样本中体量低于检测下限。
- 报告周期: 自实验室接收合格样本起,通常可在24-48检测报告。
