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病原微生物(DNA+RNA)

内江市资中县病原微生物(DNA+RNA)预约选资中县万核医学基因检测咨询中心,地址:内江市资中县水南镇苌弘路南段256号(如需办理,需提前预约),热线4001789498。快速鉴定病原体,指导精准抗感染治疗。

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报告时间:3-5个工作日
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检测项目详情

微生物(DNA+RNA)检测

产品名称:微生物(DNA+RNA)
所属分类:感染检测
产品子类:宏基因组
检测方法:NGS(下一代测序)
样本类型:体液或外周血
临床应用:指导精准治疗
报告周期:7个工作日

一、项目介绍与感染数据

微生物(DNA+RNA)检测是基于宏基因组学(mNGS)技术的新一代感染体检测方案。该技术通过对临床样本中所有微生物(细菌、、真菌、寄生虫)的DNA和RNA进行高通量测序,无需预设,即可一次性完成广谱体筛查、鉴定和部分耐药/毒力基因分析,为疑难、危重、新发及混合感染提供快速、精准的学诊断依据。

中国感染现状与挑战

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感染仍是威胁中国健康的重要问题,诊断的准确性与时效性直接临床预后。

  • 结核沉重:中国结核高国家之一,数量第三,耐药结核出现给治疗带来了巨大挑战。
  • 医院感染形势严峻:重症监护(ICU)的医院感染发生率高达15%-30%,是导致住院时间延长、医疗费用增加和死亡率上升的重要因素。
  • 细菌耐药性攀升:临床常见菌的耐药率呈持续增长趋势,特别是碳青霉烯类耐药革阴性杆菌的检出率逐年增加,导致经验性抗感染治疗失败风险增高。
  • 社区获得性肺炎(CAP)高发:作为常见的感染,不下,谱复杂,传统检测方法阳性率有限。
  • 脓毒症死亡率高:脓毒症及脓毒性凶险,率高,早期明确体并实施精准治疗是改善预后的。

在此背景下,传统微生物、涂片及靶向PCR等方法在检出率、时效性和检测范围上存在局限。微生物(DNA+RNA)mNGS检测无偏倚、广覆盖、快速的优势,成为破解感染诊断困境的重要。

二、感染诊断决策路径

在复杂的感染诊疗中,合理的诊断决策路径有助于快速锁定,优化治疗策略。以下路径展示了从经验治疗到精准治疗的进阶过程。

感染诊断决策路径图

步骤一:经验性用药 步骤二:传统/检测 步骤三:mNGS检测 步骤四:精准靶向治疗
根据临床症状、学及本地耐药数据初始治疗。 进行微生物、涂片、抗原抗体或靶向PCR检测,耗时较长,阳性率有限。 在传统方法阴性或危重/复杂时启用,快速获得广谱体信息。 依据mNGS明确的体及耐药提示,调整或启用精准抗感染方案。

该路径强调mNGS在传统方法诊断困难时的桥梁作用,助力临床实现从“经验性覆盖”到“精准打击”的转变。

三、体覆盖范围

本检测基于宏基因组学技术,可一次性覆盖数万种微生物,以下四大类别:

类别 主要覆盖体举例 临床意义
细菌 革阳性菌(如金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌)、革阴性菌(如肺炎雷伯菌、铜绿假单胞菌、鲍曼不动杆菌)、结核分枝杆菌复合群、非结核分枝杆菌(NTM)、军团菌、布鲁氏菌、诺卡菌、厌氧菌等。 诊断细菌性肺炎、血流感染、脓毒症、中枢神经系统感染、骨感染等,适用于苛菌、厌氧菌及难细菌的鉴定。
呼吸道(如流感、呼吸道合胞、、SARS-CoV-2)、疱疹(如CMV、EBV、HSV)、肠道、肝炎、罕见等。 快速识别性肺炎、脑炎脑膜炎、发热查,对于抑制宿主(如移植后)的监测。
真菌 念珠菌属、曲霉菌属、隐球菌属、肺孢子菌、毛霉菌目真菌、地方性流行性真菌(如组织胞浆菌)等。 诊断侵袭性真菌感染(IFI),如侵袭性肺曲霉菌、念珠菌血症、隐球菌脑膜炎,传统方法检测周期长,mNGS可提供快速线索。
寄生虫 刚地弓形虫、疟原虫、巴贝西虫、广州管圆线虫、肝吸虫、肺吸虫等。 诊断寄生虫感染,特别是在区、归来或缺陷中出现不明原因发热、嗜粒细胞增高时。

注:同时可对部分体耐药基因(如碳青霉烯基因、万古霉素耐药基因)和毒力因子进行检测,为治疗提供更多信息。

四、检测流程

1. 样本采集与运输:由临床医生根据感染部位,规范采集外周血、脑脊液、肺泡灌洗液、胸水等样本,使用专用采样管,低温快速运送至检测实验室。
2. 提取与建库:实验室收到样本后,同步提取样本中所有微生物的DNA和RNA,经过逆转录、片段化、加接头等步骤构建测序文库。
3. 高通量测序:将构建好的文库在NGS测序平台上进行高通量测序,生成海量的序列数据(reads)。
4. 生物信息学分析:将测序数据与经过严格质控的微生物数据库进行比对、去人源序列,鉴定出样本中存在的微生物种类序列数,并进行半定量分析。
5. 报告解读与签发:结合体序列数、临床意义、背景数据库和信息,由专业团队进行综合解读,生成最终检测报告。标准报告周期为7个工作日,紧急样本可提供加急服务。

五、在抗感染治疗监测中的应用价值

本检测用于诊断,在抗感染治疗周期管理中亦发挥重要作用:

  • 治疗前:明确感染体,区分细菌、、真菌或混合感染,抗生素滥用。
  • 治疗中:对于初始治疗无效或反复,可再次送检以评估体是否、是否发生菌群交替或出现新的耐药/继发感染。
  • 治疗后:判断治疗终点,特别是对于低下、感染不易,动态监测有助于指导疗程。
  • 学监测:可揭示医院或潜在的体传播链,为感染控制提供分子学证据。

、送检须知

重要注意事项

  • 适用人群:适用于危重、不明、经验性治疗无效、缺陷伴发热、疑似新发突发或混合感染。
  • 样本选择:采集疑似感染部位的体液样本(如脑脊液、肺泡灌洗液、胸水),体检出特异性高。外周血适用于血流感染、性感染或局部采样困难时。
  • 采样时机:建议在开始或更换抗菌药物之前采集样本,以提高检出率。若已用药,需在申请单上注明。
  • 样本质量:严格无菌操作,污染。使用指定的无菌容器和保存液,并确保样本量。
  • 信息提供:请完整填写检测申请单,基本信息、主要临床症状、疑似诊断、采样部位、用药史、状态及史等,这对结果的准确解读。
  • 结果解读:检测结果为临床诊断提供重要参考,但需由临床医生结合临床表现、影像学、实验室检查结果进行综合判断。报告中检出的体需区分是菌、定植菌还是背景菌。

微生物(DNA+RNA)检测是感染学诊断领域的强大,广泛应用将有力推动中国感染性精准诊疗水平,助力应对耐药挑战,改善预后。

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