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病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)
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查房:一位重症肺炎诊疗决策
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7:30的ICU,监护仪规律的报警声中,感染科主任正带领团队查房。"男性68岁,COPD基础,气管插管第5天,广谱抗生素使用72小时仍持续高热,肺部CT显示双肺多发斑片影进行性加重..."主管医师汇报着。主任凝视着呼吸机参数面板,转身对团队说道:"这种不明原因重症肺炎需要尽快明确体,送检微生物宏基因组检测,同时采集BALF和血标本。"
1. 项目介绍:突破传统检测瓶颈的技术革新
传统检测的三大困境:
- 依赖:60%临床体难以通过常规检出
- 检测盲区:非靶向检测无法覆盖新发/罕见体
- 时效滞后:传统药敏试验通常需要72-96小时
技术突破性进展:
- 同步检测DNA/RNA体:一次性覆盖31033种微生物
- 耐药/毒力基因分析:可检测4417种抗性基因和484种毒力因子
- 灵敏度:最低检出限达10-100拷贝数/毫升
中国感染防控现状:
- 结核数第三,每年新发约80万例
- ICU医院感染率高达15-30%,呼吸机肺炎占45%
- 耐碳青霉烯类肠杆菌检出率五年增长217%
- 社区获得性肺炎年达7.13‰
- 脓毒症28天死亡率35%
2. 检测:体覆盖
3. 技术原理:从样本到报告的标准化流程
- 样本处理:根据不同标本类型采用差异化的去宿主方案
- 提取:同步提取DNA/RNA并进行质量控制
- 文库构建:采用转座片段化与接头连接技术
- 高通量测序:Illumina平台双端150bp测序
- 生物信息分析:
- 人源序列过滤
- 微生物序列比对
- 丰度计算与标准化
- 耐药/毒力基因注释
4. 适用人群:精准检测的临床场景
- ICU重症感染:脓毒症/感染性/呼吸衰竭
- 不明原因发热:常规检测阴性且经验性治疗无效
- 抑制宿主:造血干细胞移植/HIV/AIDS/长期抑制剂使用
- 治疗失败:广谱抗生素治疗72小时无改善
- 特殊部位感染:中枢神经系统/骨/深部组织感染
5. 样本采集与送检规范
6. 抗感染治疗监测策略
- 疗效评估时间窗:抗生素调整后48-72小时复测体载量
- 复检指征:
- 临床症状反复或加重
- 影像学进展
- 炎症标志物再次升高
- 耐药监测:针对检出耐药基因每疗程至少监测1次基因变异
7. 报告解读要素
- 阳性阈值:
- 无菌部位:≥10 reads/百万
- 非无菌部位:≥100 reads/百万
- 混合感染判读:需结合临床判断前3位体相对丰度
- 耐药基因警示:检出碳青霉烯基因时需立即启动接触隔离
当主任在电子系统点击"确认送检"按钮时,肺泡灌洗液已通过专用冷链启程前往实验室。在感染精准医学时代,这项技术正为重症感染打开一扇生命之窗。
