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同源重组修复缺陷(HRR基因+HRDscore)检测(组织)

宁南县万核医学基因检测咨询中心提供凉山彝族自治州宁南县同源重组修复缺陷(HRR基因+HRDscore)检测(组织)服务,咨询热线4001789498。位于凉山州宁南县宁远镇南丝路北延段南丝路47号(如需办理,需提前预约),权威实验室检测,报告准确可靠。

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引言:从一位患者的诊疗困境说起

宁南县万核医学基因检测咨询中心提供专业的同源重组修复缺陷(HRR基因+HRDscore)检测(组织)检测服务。预约电话:400-178-9498

李女士,52岁,因腹胀、腹痛就诊,最终被诊断为高级别浆液性卵巢癌。在完成肿瘤细胞减灭术和标准含铂化疗后,主治医师面临一个关键的临床抉择:如何为李女士选择维持治疗,以最大程度延长无进展生存期,降低复发风险?是选择抗血管生成药物,还是PARP抑制剂?如果选择PARP抑制剂,是选择所有患者都适用的“泛人群”方案,还是需要依据生物标志物进行“精准”选择?此时,一份全面的同源重组修复缺陷(HRD)检测报告,将成为指导后续精准治疗、影响长期预后的关键依据。

一、 项目介绍与癌种流行病学背景

同源重组修复(Homologous Recombination Repair, HRR)是细胞修复DNA双链断裂的核心机制之一。当HRR通路相关基因(如BRCA1/2)发生致病性突变或功能异常时,会导致同源重组修复缺陷(HRD)。HRD状态使得肿瘤细胞对PARP抑制剂和铂类化疗药物高度敏感,这为卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌等多种实体瘤的治疗带来了革命性的突破。

HRD检测已成为上述癌种精准诊疗路径中不可或缺的一环。它通常包含两部分:HRR基因突变检测(寻找“因”)和基因组瘢痕分析(计算HRDscore,评估“果”)。两者结合,能更全面地识别出可能从PARP抑制剂治疗中获益的患者群体。

以卵巢癌和乳腺癌为例,其在中国人群中的疾病负担沉重,精准治疗需求迫切:

  • 卵巢癌:据中国国家癌症中心最新统计数据显示,中国年新发病例数约5.7万例,死亡病例数约2.7万例。由于早期症状隐匿,约70%的患者确诊时已为晚期(III/IV期),总体5年生存率长期徘徊在40%左右。高发年龄在50-60岁。
  • 乳腺癌:是中国女性发病率最高的恶性肿瘤,年新发病例数高达约42.3万例。尽管随着筛查普及和治疗进步,总体5年生存率已提升至83%以上,但晚期乳腺癌的预后仍不乐观。HRD相关的三阴性乳腺癌和激素受体阳性乳腺癌是治疗难点,患者存在明确的精准治疗需求。
  • 前列腺癌:在中国男性中的发病率呈快速上升趋势,年新发病例数约11.5万例。转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)阶段预后差,HRD检测(特别是HRR基因突变)已写入国内外指南,用于指导PARP抑制剂的应用。

二、 检测内容详解

本检测采用下一代测序(NGS)技术,一次性全面评估HRD状态,为临床用药提供多层次证据。

检测模块 检测内容 相关靶向药物 主要临床适应症(示例) 临床意义/证据等级
HRR基因突变 检测28个HRR通路核心基因(含BRCA1, BRCA2)的外显子区域点突变、小片段插入缺失。 PARP抑制剂(如奥拉帕利、尼拉帕利、帕米帕利等)、铂类药物 卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌的维持治疗或后线治疗 高级别证据(基于III期临床试验),国内外指南I类推荐。
基因组瘢痕分析 (HRDscore) 通过分析基因组杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因不平衡(TAI)、大片段迁移(LST)三种特征,计算HRD综合评分。 PARP抑制剂 卵巢癌一线维持治疗(无论BRCA突变状态) 高级别证据。HRD阳性(评分≥阈值)是PARP抑制剂疗效的独立预测标志物。

不同检测方案的覆盖度与选择:目前临床上有仅检测BRCA1/2、检测多基因HRR panel、以及HRR基因+HRDscore联合检测等不同方案。对于卵巢癌一线维持治疗,BRCA突变或HRD阳性均可指导用药,因此HRR基因+HRDscore联合检测覆盖最全,能最大化识别获益人群。对于后线治疗或乳腺癌、前列腺癌,HRR基因突变是当前主要的用药依据,但HRDscore的补充信息具有重要的预后提示和临床研究价值。选择时应根据癌种、治疗线数及临床指南推荐综合决策。

三、 检测技术原理(NGS流程)

1. 样本处理与建库:从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织切片或新鲜组织中提取基因组DNA,经过质检后,将DNA片段化并连接测序接头,构建测序文库。

2. 目标区域捕获与测序:使用特异性探针同时捕获28个HRR基因的全部外显子区域以及用于基因组瘢痕分析的约6万个单核苷酸多态性(SNP)位点。捕获后的文库在高通量测序仪上进行双端测序,确保数据深度与均一性。

3. 生物信息学分析

  • 变异分析:将测序数据与人类参考基因组比对,识别HRR基因的点突变和插入缺失突变,并进行致病性解读(根据ACMG指南)。
  • HRDscore计算:基于SNP位点的等位基因频率,通过专利算法计算LOH、TAI、LST三个基因组不稳定性指标,并整合为综合HRDscore。通常设定特定阈值(如42分),高于阈值判读为HRD阳性。

四、 适用人群与临床场景

  • 初诊分型:新确诊的晚期高级别上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌患者,用于指导一线含铂化疗后的维持治疗策略选择。
  • 耐药换药:对铂类化疗敏感或既往PARP抑制剂治疗有效的复发患者,再次检测可评估HRD状态是否改变,为后续治疗提供参考。
  • 术后监测:对于已接受手术和初步治疗的乳腺癌、前列腺癌患者,明确HRD状态有助于规划辅助治疗或早期复发干预策略。
  • 遗传评估:检测到胚系BRCA1/2或其它HRR基因致病突变,提示患者可能患有遗传性肿瘤综合征,需进行遗传咨询并对其家族成员进行风险管理。
  • 筛查:对于有强烈家族史的高危个体,在肿瘤发生前进行基因检测属于遗传筛查范畴,与本治疗性检测目的不同,需区分。

五、 检测流程

1. 临床医嘱:临床医师根据患者病情,开具“同源重组修复缺陷(HRR基因+HRDscore)检测”申请单。
2. 样本采集:病理科提供肿瘤组织样本(首选手术或穿刺获取的FFPE组织块或未染色切片)。
3. 样本寄送:样本与申请单一起,置于专用转运盒中冷链运输至检测实验室。
4. 实验室检测:实验室接收样本后,进行病理评估(确认肿瘤细胞含量≥20%)、核酸提取、建库、测序及生信分析,全程约需10个工作日。
5. 报告出具:生成并审核数字化报告,通过安全方式发送至临床。

六、 治疗后的预防与监测

对于HRD阳性并接受PARP抑制剂维持治疗的患者,系统的随访监测至关重要:

  • 常规随访:治疗期间需定期(如每2-3个月)进行影像学评估(CT/MRI)、肿瘤标志物(如CA125、PSA)检测及血常规、肝肾功能监测,以评估疗效和管理不良反应。
  • ctDNA动态监测:通过检测血液中循环肿瘤DNA(ctDNA),可以比影像学更早地监测到分子层面的复发迹象,并可能发现新的耐药突变,指导后续治疗。
  • 微小残留病(MRD)评估:在根治性治疗(如手术)后,利用超高灵敏度测序技术监测ctDNA,评估MRD状态。MRD阳性提示复发高风险,需要更密切的随访或考虑干预措施。

七、 报告解读要点

临床医师在解读报告时,应重点关注以下部分:

  • HRR基因突变结果:明确是胚系突变还是体细胞突变。胚系突变具有遗传性,体细胞突变仅存在于肿瘤中。报告会给出突变的致病性分类(致病、可能致病、意义不明等),只有致病/可能致病突变才具有明确的临床指导意义。
  • HRDscore结果:明确评分是否达到阳性阈值。阳性结果支持使用PARP抑制剂。
  • 综合用药建议:报告会基于基因突变和HRDscore结果,汇总符合患者情况的已获批靶向药物信息,并注明对应的癌种和线数。
  • 临床试验匹配:对于标准治疗选择有限的患者,报告可能提示其分子特征是否符合正在开展的特定临床试验入组条件,为患者提供新的治疗希望。

总结而言,HRR基因与HRDscore的联合检测,实现了从“单一基因”到“通路功能”的跨越,是精准医学在卵巢癌等实体瘤治疗中的典范应用。它不仅能直接指导PARP抑制剂的精准使用,延长患者生存,其结果的解读也贯穿了遗传风险评估、治疗反应预测和复发监测的全病程管理,真正体现了“一次检测,全程管理”的价值。

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