病原微生物宏基因组测序数据分析

查房：一名感染科医生的临床抉择

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七点三十分，ICU的监护仪器发出规律提示音。张医生站在3床前皱着眉头翻看检验报告：持续高热5天，白细胞计数2.3×10⁹/L，CRP 156mg/L，但血三次均为阴性。"经验性使用广谱抗生素已三天，仍在进展..."这种场景ICU并不罕见——我国ICU感染发生率高达15-30%，而脓毒症死亡率30%。看着监护仪上跳动的数字，张医生做出了决定："送检微生物宏基因组测序。"

一、感染诊断的现实挑战

传统检测方法的局限性正日益凸显：

• 依赖：约60%临床样本无法获得阳性结果，结核诊断尤为——我国结核数第三，但传统需4-8周
• 时效滞后：社区获得性肺炎达7.13/1000人年，但痰敏感度不足50%
• 耐药困境：近年临床分离菌株中，MRSA检出率达35.8%，碳青霉烯类耐药肺炎雷伯菌增长至13.4%

二、技术原理：从样本到报告流程

微生物宏基因组测序(mNGS)通过以下步骤实现体鉴定：

1. 样本处理：血液、组织等样本经均质化处理
2. 提取：同时捕获微生物游离DNA/RNA
3. 建库测序：采用高通量测序平台完成序列读取
4. 生物信息分析：比对3万种微生物参考基因组
5. 临床解读：结合宿主背景剔除污染序列

三、覆盖谱系

四、临床应用场景

以下推荐送检：

• 不明原因发热：传统检测阴性仍持续高热≥3天
• 重症感染：脓毒症、多器官功能障碍
• 缺陷：造血干细胞移植后发热、HIV合并感染
• 术后感染：人工材料感染
• 复杂肺炎：机械通气疑似VAP

五、指导精准抗感染治疗

基于测序结果可实现：

• 靶向治疗：调整抗生素覆盖检测到的特异性
• 降阶梯治疗：在重症早期广谱覆盖后精准缩窄抗菌谱
• 耐药评估：通过耐药基因预测指导用药选择
• 疗程优化：根据体载量动态变化调整治疗周期

、感染防控延伸价值

除个体化诊疗外，该技术还可用于：

• 院感暴发溯源：识别耐药菌传播链
• 耐药趋势监测：建立区域耐药基因图谱
• 治疗效果评估：动态监测体基因组变异
• 新原预警：发现罕见或新发微生物

在48小时报告周期，这项技术为临床医生提供了与传统互补的诊断。当张医生在查房记录上写下"根据mNGS报告调整抗感染方案"时，监护仪上的氧饱和度数值终于开始回升——这或许就是精准医学带给重症感染的新希望。

* 以上价格仅供参考，实际价格以机构为准

预约流程

1. 在线预约：通过本平台预约，客服会在1小时内与您联系确认。

2. 到院采样：按预约时间前往机构，由专业人员采集样本。

3. 等待结果：样本送检后3-5个工作日出具检测报告。

4. 获取报告：支持自取、快递、电子邮件等多种方式。

注意事项

1. 提前预约：请至少提前1天预约，以便安排检测时间。

2. 携带证件：请携带本人有效身份证件。

3. 退改政策：未采样前支持随时退款；如需改期请提前联系客服。