多重病原靶向测序
巴音郭楞焉耆县多重病原靶向测序预约选焉耆县万核医学基因检测咨询中心,地址:新疆巴音州焉耆县新桥路4737号(如需办理,需提前预约),热线4001789498。快速鉴定病原体,指导精准抗感染治疗。
在感染性临床诊疗中,医生们常常面临这样的困境:高热不退,感染指标不下,但传统微生物结果却反复阴性;,经验性抗感染治疗已覆盖常见,但依然进展,我们不禁要问——是否覆盖了非体?是否存在耐药?面对ICU重症感染、抑制宿主感染等复杂,快速、、精准地锁定“真凶”并明确耐药特性,是决定治疗成败。
1. 项目介绍:传统局限、技术突破与中国感染现状
巴音郭楞蒙古自治州焉耆回族自治县多重病原靶向测序预约选焉耆回族自治县万核医学基因检测咨询中心提供专业的多重病原靶向测序检测服务。预约电话:400-178-9498
传统学诊断方法,如涂片镜检、、抗原抗体检测等,存在周期长、灵敏度有限、通量低等固有局限。法作为“金标准”,对苛菌、厌氧菌、及已接受抗菌治疗检出率显著降低,导致大量临床感染无法获得学依据。而经验性用药的盲目性,则可能加剧细菌耐药和不良预后。
多重靶向测序(mNGS-T)技术应运而生,它结合了多重PCR高灵敏度靶向富集与二代测序高通量的优势,实现了对特定体的精准捕获与深度测序。本项目针对临床常见体及耐药基因进行靶向设计,有效去除了宿主背景干扰,显著提升了检测灵敏度与报告速度。
在中国,感染沉重,形势严峻:
- 结核沉重:我国结核高国家之一,数量第三,耐药结核出现给防控带来巨大挑战。
- 医院感染问题突出:重症监护室(ICU)医院感染发生率高达15-30%,是导致住院时间延长、医疗费用增加和死亡率升高的重要因素。
- 细菌耐药形势严峻:临床分离菌中耐药菌的检出率持续增长,碳青霉烯类耐药革阴性杆菌(CRO)等问题日益凸显。
- 社区感染不容忽视:社区获得性肺炎高,谱复杂;脓毒症死亡率不下,早期明确与耐药性是改善预后的核心环节。
2. 检测
本检测项目采用多重PCR扩增与二代测序技术,一次性覆盖临床常见的微生物及耐药基因,如下表:
总计检测目标:219种临床常见体,828种耐药基因及分型。
3. 技术原理与流程
本检测遵循严格的实验室操作规范与质控体系,确保结果准确可靠:
- 样本处理与提取:根据不同样本类型(如血液、痰液、脑脊液等)进行前处理,采用优化的方法同步提取DNA与RNA,最大限度获取体。
- 靶向文库构建:使用设计的多重PCR引物池,对目标体及耐药基因的特异性区域进行多重PCR扩增富集,同时样本特异性标签(Barcode)和测序接头。
- 高通量测序:纯化后的文库在二代测序平台上进行高通量测序,产生海量序列数据。
- 生物信息学分析:原始数据经过去除低质量序列、去除宿主序列后,与经过严格校准的体及耐药基因专用数据库进行比对、注释和统计。通过算法判断体检出与否相对丰度,并解析耐药基因信息。
- 报告生成:最终生成体列表、耐药基因信息及临床解读建议的标准化报告。
整个检测流程可在24-48完成,为临床决策提供快速依据。
4. 适用人群(临床适应证)
本检测适用于以下复杂或危重感染:
- ICU重症感染:如脓毒症、脓毒性、呼吸机肺炎(VAP)、导管血流感染等,需快速明确以指导精准治疗。
- 不明原因发热/不明原因感染:经初步检查和经验性治疗无效,不明。
- 抑制宿主:如造血干细胞移植、实体器官移植后、长期使用抑制剂、肿瘤放化疗、等,感染体复杂、不、进展快。
- 抗感染治疗失败或反复:经验性或靶向治疗后临床反应不佳,怀疑存在未覆盖体或耐药。
- 特殊部位或特殊体感染:如中枢神经系统感染、胸感染、骨感染等,以及怀疑结核、非结核分枝杆菌(NTM)、真菌、等传统方法难以快速检测的体感染。
5. 样本采集、保存与送检规范
正确的样本采集与运输是保证检测质量的前提。请以下指南:
请在申请单上填写临床信息、可疑诊断、抗菌药物使用等,以实验室及报告解读。
6. 抗感染治疗监测与疗效评估
本检测用于诊断,还可作为治疗监测的有效:
- 疗效评估时机:对于初始治疗有效的,一般不建议常规复查。若临床症状、体征及常规感染指标(如PCT、CRP)持续改善,则支持现有治疗方案。
- 复检指征:当出现以下时,应考虑复查:
- 初始治疗后3-5天,临床表现无改善或恶化。
- 感染指标一度下降后再次升高。
- 出现新的感染灶或临床症状。
- 抑制需要持续监测感染负荷。
- 耐药监测价值:检测报告中提供的耐药基因信息,可用于解释治疗失败原因,预测药物敏感性,为调整抗菌方案(如从碳青霉烯类降阶梯或更换为更敏感药物)提供分子依据。但需注意,耐药基因的检出需结合体检出综合解读,且存在基因表达与表型一致的可能,有条件的应进行表型药敏验证。
7. 报告解读要点
本检测报告为临床医生提供微生物和耐药基因的分子证据,解读时需紧密结合临床表现、影像学、实验室检查及治疗反应进行综合判断。
- 阳性判断阈值:报告基于统计学模型和数据库比对,设定严格的阈值以区分真实信号与背景噪音。通常会对检出的体给出“疑似”或“检出”等分级提示。极低序列数的结果需解读,可能为定植、污染或既往感染。
- 混合感染:本技术能有效揭示混合感染。报告中会列出所有检出的体相对丰度。需结合临床判断各体的主次角色。例如,在支气管肺泡灌洗液中同时检出细菌和,可能提示合并感染或继发细菌感染。
- 耐药基因解读:
- 与检出体的耐药基因。例如,在检出肺炎雷伯菌的同时,检出blaKPC基因,强烈提示该菌对碳青霉烯类耐药。
- 注意耐药基因的“沉默”携带,即携带基因但未表达相应耐药表型。
- 报告可能检出某些泛耐药菌的标志性基因(如mcr-1),重要的学预警价值。
- 阴性结果的解读:阴性结果有助于排除报告中涵盖的体感染,但无法排除数据库外的罕见体、体载量低于检测下限、或样本采集不当。
总之,多重靶向测序是传统诊断技术的重要与升级。它快速、、精准的特点,正成为应对复杂感染、重症感染及新发突发诊断的强大,助力临床实现从经验性治疗到精准靶向治疗的跨越,为改善预后、遏制细菌耐药贡献力量。
