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病原微生物宏基因组测序数据分析

上海市万核医学基因检测咨询中心提供上海市黄浦区病原微生物宏基因组测序数据分析服务,咨询4001789498。上海市杨浦区中山北二路944号(如需办理,需提前预约),病原微生物基因检测,结果准确快速。

预约价 ¥4600
¥5750
省¥1150
报告时间:3-5个工作日
服务保障:
官方授权免费改期隐私保护
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检测项目详情

1. 项目介绍

上海市万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物宏基因组测序数据分析检测服务。预约电话:400-178-9498

临床案例:

方法存在显著局限:长(结核分枝杆菌需2-8周)、阳性率低(血10%)、无法覆盖非体。宏基因组测序技术突破性地实现了:

  • 无需预设靶标,一次性检测细菌、真菌、寄生虫等18000+li>
  • 检测灵敏度达100拷贝/毫升,较传统方法提升10-100倍
  • 同步解析耐药基因,指导精准用药

严峻:结核年新发约74万例感染率15-30%,耐碳青霉烯类肺炎菌检出率10年增长8倍,社区获得性肺炎-4%,脓毒症死亡率高达35%。

2. 检测>
检测数量 灵敏度 特异度
细菌 15000+ >95% >99%
3000+ >90% >98%
真菌 500+ >85% >97%
寄生虫 200+ >80% >96%

3. 技术原理

标准化操作流程:

  • 样本处理:组织研磨/血液稳定化处理
  • <:双链DNA/RNA同步捕获,去除人干扰
  • 文库构建:片段化末端修复+接头连接+PCR扩增
  • 高通量测序:双端150bp读长,数据量≥20M reads
  • 生物信息分析:人源序列过滤→微生物数据库比对→丰度统计→耐药基因注释

4. 适用人群

以下临床场景:

  • ICU重症感染(脓毒症、呼吸衰竭等)
  • 不明原因发热>7天
  • (移植后、HIV、肿瘤化疗)
  • 经验性治疗72小时无效
  • 中枢神经系统/骨特殊部位感染

5. 样本采集与送检

样本类型 最低体积 保存条件 运输要求
外周血 4mL 4℃() 冰袋运输
组织 米粒大小 -80℃或RNA保护液 干冰运输
肺泡灌洗液 2mL -80℃ 干冰运输

6. 抗感染监测

疗效评估时机:治疗7-10天后可复检体序列数下降>50%提示治疗有效

复检指征:

  • 临床症状无改善或恶化
  • 新发感染灶出现
  • <状态发生重大变化

耐药监测:重点监测mecA、blaKPC、vanA等高频耐药基因变异

7. 报告解读

阳性判定标准:

  • 细菌/真菌:基因组覆盖度≥1%且reads数>50
  • 覆盖度≥5%
  • 结核分枝杆菌复合群:特异性序列≥3条

混合感染提示:检出≥且均达到阳性阈值时,需结合临床主次

耐药基因解读:需区分固有耐药(如肺炎对氨苄西林天然耐药)与获得性耐药

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