病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)
在镇江市润州区做病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA),推荐润州区万核医学基因检测咨询中心(镇江市润州区黄山南路61号(如需办理,需提前预约)),电话4001789498。专业病原检测,助力感染性疾病精准诊疗。
感染科主任视角:当临床遇见病原微生物宏基因组检测
在镇江市润州区做病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA),推荐润州区万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)检测服务。预约电话:400-178-9498
清晨ICU查房,面对一位高热不退、呼吸急促的重症肺炎患者,血常规提示炎症指标飙升,但常规病原学检查结果均为阴性。主治医生焦急地追问:究竟是哪种病原体在作祟?是否已经产生耐药?此刻,我作为感染科主任,果断决定——立即送检病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)。这是一种基于二代测序技术的全面病原筛查方案,能够突破传统培养的局限,快速锁定致病元凶。
1. 项目介绍
传统病原检测的局限与宏基因组技术的突破
在感染性疾病的诊断中,传统方法如细菌培养、血清学检测和PCR存在明显不足:培养耗时长(通常需3-5天)、阳性率低(尤其在抗生素使用后),且无法覆盖病毒、真菌及罕见病原体;PCR则仅能针对已知特定病原,易漏检未知或变异株。而病原微生物宏基因组检测通过高通量测序技术,无需预设靶标,一次性对样本中全部微生物核酸(DNA和RNA)进行无偏倚测序,从而实现广谱、快速、精准的病原鉴定。
中国感染性疾病的严峻现状
我国感染性疾病负担沉重:结核病患者数量居全球第三,ICU医院感染率高达15-30%,耐药菌检出率逐年攀升,社区获得性肺炎发病率持续高位,脓毒症相关死亡率更是重症感染中的主要挑战。这些数据凸显了对新型、高效诊断技术的迫切需求。
2. 检测内容
注:总病原微生物检测种类达31033种,涵盖临床常见及罕见病原。
3. 技术原理
病原微生物宏基因组检测基于二代测序技术,流程严谨:
- 样本处理:根据不同样本类型(如血液、痰液等)进行预处理,去除人源背景干扰。
- 核酸提取:同步提取DNA和RNA,确保全面捕获病原体遗传物质。
- 文库构建
- 测序:采用高通量平台进行双端测序,生成海量数据。
- 生物信息学分析:通过人源序列滤除、病原比对、丰度计算及耐药/毒力基因注释,最终生成临床报告。
4. 适用人群
本检测适用于以下临床场景:
- ICU重症感染患者,尤其是脓毒症、呼吸衰竭等危急情况;
- 不明原因发热,经常规检查未能明确病原者;
- 免疫低下人群(如移植术后、化疗后、HIV感染者);
- 初始抗感染治疗失败,需调整方案的患者;
- 特殊部位感染(如中枢神经系统、胸腔、腹腔等)需精准病原鉴定时。
5. 样本采集与送检
规范采样是保证检测准确性的前提:
- 静脉血:采集于无菌EDTA抗凝管,室温运送,避免冷冻;
- 痰液/肺泡灌洗液:无菌容器收集,冰袋低温运输;
- 脑脊液/腹水/胸腔积液:无菌管采集,立即送检或暂存4°C;
- 拭子:采用专用转运培养基,避免干燥;
- 实体组织:无菌保存于生理盐水,快速冷冻送检;
- 粪便:专用容器收集,冷藏运输。
所有样本需标识清晰,避免污染,并在采集后尽快送达实验室。
6. 抗感染监测
本检测不仅用于诊断,亦可用于治疗监测:
- 疗效评估时机:建议于抗感染治疗3-5天后复检,动态观察病原载量及耐药基因变化;
- 复检指征:临床表现无改善、新发症状或疑似二重感染时;
- 耐药监测:通过持续监测抗性基因表达,指导抗生素阶梯使用,遏制耐药菌传播。
7. 报告解读
临床医生需结合患者情况审慎解读报告:
- 阳性阈值:病原序列数需达到一定丰度阈值(通常结合背景噪音及临床意义设定),避免假阳性;
- 混合感染:报告可能提示多种病原共存,需区分定植与致病,优先考虑高丰度病原;
- 耐药基因:检测到的抗性基因需与表型耐药关联分析,为精准用药提供依据。
作为感染科医生,宏基因组检测为我们提供了强大的诊断工具,但必须整合临床、影像及实验室其他指标进行综合判断,最终实现个体化抗感染治疗。
