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肿瘤全外显子测序(组织)

庐阳区万核医学基因检测咨询中心是合肥市庐阳区专业肿瘤全外显子测序(组织)检测预约机构,位于合肥市庐阳区濉溪路11号(如需办理,需提前预约),预约电话4001789498。服务覆盖瑶海区、庐阳区、蜀山区等地,为肿瘤患者提供精准靶向用药基因检测服务。

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肿瘤全外显子测序(组织)对比分析介绍

庐阳区万核医学基因检测咨询中心提供专业的肿瘤全外显子测序(组织)检测服务。预约电话:400-178-9498

产品概述:肿瘤全外显子测序(组织)是一种基于新一代测序技术,对肿瘤组织样本中约2万个基因的全部外显子区域进行高通量测序的检测方法。它能全面揭示与肿瘤发生发展、治疗及预后相关的体细胞与胚系基因变异,为实体瘤患者的精准诊断、治疗策略制定、微小残留病灶监测及遗传风险评估提供关键分子依据。

1. 为什么需要肿瘤全外显子测序?

恶性肿瘤是严重威胁中国居民健康的重大疾病。根据中国国家癌症中心发布的最新数据,中国恶性肿瘤年新发病例数约为406.4万例,平均每天有超过1万人被确诊。恶性肿瘤的死亡率高居各类疾病前列,每年导致约241.4万人死亡。尽管近年来诊疗水平有所提升,但我国癌症总体5年生存率仍与发达国家存在差距,约为40.5%。癌症发病具有明显的年龄和性别差异,多数癌种在40岁后发病率快速上升,高发年龄集中在60-74岁;总体而言,男性发病率略高于女性。

面对如此严峻的防控形势,传统的病理分型已无法满足个体化精准医疗的需求。肿瘤的发生本质上是由基因变异驱动的。肿瘤全外显子测序能够一次性、全景式地描绘肿瘤的基因组图谱,精准识别驱动突变、耐药机制、免疫治疗相关标志物(如TMB、MSI)以及遗传风险,从而帮助医生为患者“量体裁衣”,选择最有效的靶向药物、免疫治疗或化疗方案,并评估预后,这对于提高治疗效果、延长患者生存期、改善生活质量至关重要。

2. 不同样本类型检测方案对比

肿瘤基因检测的准确性高度依赖于样本的质量和代表性。临床上常用的样本类型主要包括肿瘤组织、外周血循环肿瘤DNA(ctDNA)以及胸腹水等体液。以下是主要样本类型的对比分析:

对比维度 肿瘤组织(石蜡/新鲜/穿刺) 外周血ctDNA(液体活检) 胸腹水等体液
样本本质 肿瘤原发或转移灶的直接组织样本,是诊断的“金标准”。 血液中游离的肿瘤来源DNA片段,代表全身肿瘤负荷的“快照”。 体腔积液中的脱落肿瘤细胞及游离DNA,反映局部转移灶情况。
主要优势 DNA含量丰富,肿瘤细胞比例(肿瘤纯度)高,能检测最全面、最准确的基因变异信息,包括点突变、Indel、CNV、融合等,是初次诊断和全面分子分型的首选。 无创、便捷、可重复取样,能克服肿瘤异质性,实时动态监测肿瘤演变、耐药及微小残留病灶,尤其适用于组织难以获取或治疗后监测。 对于发生胸腹膜转移的患者,取样相对微创,能提供局部转移灶的分子信息,有时肿瘤细胞含量较高。
局限性 有创取样,可能受限于手术可及性;无法完全克服肿瘤空间异质性;单次取样反映的是特定时间点的静态信息。 ctDNA含量可能较低(尤其在早期或低负荷肿瘤中),检测灵敏度受限制;对拷贝数变异、基因融合等结构性变异的检测能力通常弱于组织。 并非所有患者都会产生胸腹水;样本中可能混有大量炎性细胞,影响肿瘤细胞比例;预处理流程较复杂。
临床应用侧重 初始诊断与全面分子图谱构建:指导一线靶向/免疫/化疗方案选择;评估HRD、TMB、MSI等综合指标;进行遗传性肿瘤筛查。 动态监测与耐药管理:术后MRD监测;治疗疗效评估;早期发现耐药突变;晚期患者无法获取组织时的替代检测。 局部转移灶的补充诊断:当组织或血液检测不可行时,作为替代样本用于基因检测,指导局部治疗。

3. 肿瘤组织全外显子测序的特点与优势

基于肿瘤组织样本的全外显子测序,在实体瘤精准诊疗中扮演着不可替代的核心角色,其核心优势包括:

一、信息全面且权威:作为病理诊断的金标准延伸,它能系统性地检测近2万个基因的全部外显子区域,不仅覆盖了与靶向、免疫、化疗、预后及遗传相关的888个核心基因,还包含15个MSI位点,提供最完整的突变谱。

二、检测变异类型广泛:

  • 体细胞突变:精准识别单核苷酸变异、小片段插入缺失、核心基因的拷贝数变异以及已知的基因融合,为靶向治疗提供直接依据。
  • 胚系突变:同步分析遗传性肿瘤相关基因的胚系变异,明确患者的遗传风险,惠及家族健康管理。
  • 基因组不稳定性指标:一次性评估同源重组修复缺陷状态、肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性,为PARP抑制剂和免疫检查点抑制剂的临床应用提供关键决策支持。

三、指导价值深远:其检测结果不仅能指导当前的治疗方案选择,还能为未来可能的耐药和后续线治疗储备潜在的靶点信息,实现“一次检测,终身受益”的长期管理价值。

4. 如何选择检测样本与时机?

选择何种样本进行全外显子测序,需根据患者的临床情境和治疗阶段综合决定:

首选肿瘤组织检测的情况:

  • 初诊初治患者:尤其是计划进行根治性手术或需要制定一线精准治疗方案的晚期患者,应优先使用手术或活检获取的肿瘤组织进行检测,以获得最全面、最可靠的基线基因组图谱。
  • 需要评估HRD、TMB等综合指标:这些指标的评估对样本质量和肿瘤细胞含量要求高,组织样本是最佳选择。
  • 疑似遗传性肿瘤:需要区分体细胞突变与胚系突变时,结合肿瘤组织和配对血液或唾液样本进行分析是标准流程。

考虑血液ctDNA或胸腹水检测的情况:

  • 组织样本无法获取或量不足:当患者无法进行有创活检,或既往组织样本陈旧、量少无法满足检测要求时。
  • 治疗过程中的动态监测:用于术后评估微小残留病灶风险,或治疗期间定期监测疗效、早期发现获得性耐药。
  • 肿瘤异质性评估:作为组织检测的补充,血液ctDNA有助于了解全身肿瘤的克隆构成。

理想情况下,可以采取“组织基线检测+血液动态监测”的组合策略,实现全病程的精准管理。

5. 肿瘤预防与治疗监测建议

基于全外显子测序提供的深度信息,患者和医生可以采取更主动的管理策略:

预防层面(针对胚系突变携带者):若检测发现明确的遗传性肿瘤相关胚系致病突变,建议患者的一级亲属进行遗传咨询和针对性基因检测,以便进行早期筛查和干预,实现早诊早治。

治疗与监测层面:

  • 指导精准治疗:严格依据检测报告提示的敏感或耐药证据,选择已获批或处于临床试验阶段的靶向/免疫药物。
  • 疗效监测:在治疗开始后,可按临床指南建议的周期,通过血液ctDNA检测进行动态监测,评估分子层面的缓解深度,比影像学更早提示疗效。
  • 复发预警:对于已完成根治性治疗的患者,定期进行高灵敏度的MRD检测,可在临床复发前数月预警风险,为干预赢得时间。
  • 耐药后管理:一旦发生临床进展,建议重新进行基因检测(可考虑使用新活检组织或血液ctDNA),以明确耐药机制,指导后续治疗。

6. 检测须知

为确保检测的顺利开展和结果的可靠性,请注意以下事项:

样本要求:

  • 组织样本:石蜡切片需提供足够厚度与数量的切片,确保肿瘤细胞比例通常建议高于20%;新鲜组织或穿刺组织需尽快置于专用保存液中低温运送;请务必由病理医生评估确认样本中肿瘤细胞含量并圈定目标区域。
  • 血液样本:如进行胚系对照或液体活检,需使用专用采血管采集足量外周血,并按要求保存和运输。

临床信息:请完整提供患者的临床诊断、病理分型、分期、既往治疗史等关键信息,这对数据的准确分析和解读至关重要。

报告周期:本检测涉及复杂的湿实验与生物信息学分析,标准报告周期约为15个工作日。

结果解读:检测报告由专业的生物信息分析师和临床专家共同生成,但最终结果必须由主治医生结合患者的全面临床情况进行分析和决策。基因检测是重要的工具,但不能替代医生的临床判断。

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