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肿瘤同源重组缺陷(HRD)

合肥市肥西县肿瘤同源重组缺陷(HRD)预约就选肥西县万核医学基因检测咨询中心,地址:安徽省合肥市肥西县上派镇合安路(如需办理,需提前预约),全国热线4001789498。基于NGS高通量测序,精准匹配靶向药物,助力个体化治疗。

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肿瘤同源重组缺陷(HRD)检测对比分析介绍

1. 为什么需要检测肿瘤同源重组缺陷(HRD)?

合肥市肥西县肿瘤同源重组缺陷(HRD)预约就选肥西县万核医学基因检测咨询中心提供专业的肿瘤同源重组缺陷(HRD)检测服务。预约电话:400-178-9498

同源重组修复(HRR)是细胞修复DNA双链损伤的核心机制之一。当这一通路的关键基因(如BRCA1/2)发生突变或功能缺失时,会导致同源重组缺陷(HRD)。HRD状态的肿瘤细胞基因组不稳定,但对某些DNA损伤药物(如PARP抑制剂)和铂类药物更为敏感。因此,准确评估HRD状态对于多种实体瘤的精准治疗、预后判断及遗传风险评估至关重要。

HRD检测的主要临床应用癌种包括乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌和宫颈癌等。根据中国国家癌症中心发布的最新统计数据:

  • 乳腺癌:是中国女性发病率最高的恶性肿瘤,年新发病例数约42万,死亡率居女性癌症死亡谱前列。5年相对生存率总体已达80%以上,但晚期患者预后较差。高发年龄在45-55岁,女性占绝对多数。
  • 卵巢癌:年新发病例数约5.7万,死亡率居妇科恶性肿瘤之首,5年生存率长期徘徊在较低水平,约40%。高发年龄为50-60岁。
  • 子宫内膜癌:年新发病例数约8.2万,发病率呈上升趋势。5年生存率相对较高,约70%。高发年龄为50-60岁。
  • 宫颈癌:年新发病例数约11万,死亡率在妇科肿瘤中仅次于卵巢癌。随着筛查普及,5年生存率有所提升。高发年龄呈双峰分布(35-39岁和60-64岁)。

在上述癌种中,存在一定比例的患者携带BRCA1/2基因突变或呈现HRD阳性状态。通过HRD检测筛选出这部分患者,能够为她们提供从PARP抑制剂靶向治疗中获益的重要机会,从而改善生存预后。

2. 检测方案技术对比:一代测序 vs. 二代测序(NGS) vs. 三代测序

HRD状态的评估主要包括BRCA1/2基因的突变检测和基因组瘢痕分析。不同的测序技术在此应用上各有特点。

技术平台 核心技术原理 在HRD检测中的应用与特点 主要局限性
一代测序(Sanger法) 链终止法,直接读取单一片段的DNA序列。 主要用于对BRCA1/2等特定基因的已知热点突变或小片段进行精准验证。被视为基因突变检测的“金标准”,准确率高。 通量极低,一次只能分析一个片段;无法检测大片段重排、拷贝数变异及全基因组范围内的瘢痕信号;成本效益低,不适合大规模、多基因并行检测。
二代测序(NGS,高通量测序) 大规模并行测序,可同时对数百万个DNA片段进行测序。 当前HRD检测的主流技术。可一次性完成BRCA1/2等数十个HRR通路相关基因的胚系与体系突变、拷贝数变异、大片段重排的检测,并结合生物信息学算法(如LOH、TAI、LST)计算基因组不稳定性评分(GIS),全面评估HRD状态。平衡了通量、精度与成本。 读长相对较短(通常150-300bp),对高GC含量区域、高度同源序列的拼接可能存在挑战;数据分析复杂,对生物信息学解读能力要求高。
三代测序(单分子实时/纳米孔测序) 单分子实时测序,产生超长读长。 读长可达数万碱基,能跨越复杂重复区域和结构变异断点,在检测复杂结构变异、等位基因特异性表达及甲基化修饰方面有潜在优势,可能未来有助于更精细地解析HRD机制。 当前单碱基错误率相对较高;成本高昂;在HRD临床常规检测中的应用尚处于早期研发和验证阶段,未大规模普及。
综合评价 对于临床HRD检测,二代测序(NGS)是目前最成熟、最全面的技术选择。它能够整合突变与基因组瘢痕信息,提供一站式解决方案,满足临床对精准分型的需求。一代测序作为特定情况下的补充验证手段。三代测序代表未来技术方向,但距离常规临床应用尚有距离。

3. NGS技术检测HRD的特点与优势

基于NGS的HRD检测方案具有以下核心特点与优势:

  • 全面性:不仅检测BRCA1/2基因的点突变、小插入缺失,还能有效检出大片段重排和拷贝数变异,覆盖更广泛的HRR基因谱。
  • 基因组瘢痕分析:能够通过分析肿瘤样本DNA的杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因失衡(TAI)、大片段迁移(LST)等特征,计算出基因组不稳定性评分。即使未发现明确的HRR基因突变,高GIS评分也能提示HRD阳性,扩大了可能从PARP抑制剂治疗中获益的患者人群。
  • 高灵敏度与通量:可同时处理多个样本、多个基因,适合临床批量检测需求。对样本中低丰度突变也具有较高检测灵敏度。
  • 样本兼容性:可使用福尔马林固定石蜡包埋的组织样本或血液样本(用于胚系突变检测),灵活应对临床不同情况。
  • 指导价值明确:检测结果直接关联PARP抑制剂的用药指导,已被国内外多项权威临床指南推荐,用于卵巢癌、乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌等患者的治疗决策。

4. 如何选择合适的HRD检测

患者和临床医生在选择HRD检测时,可参考以下要点:

  • 明确检测目的:是用于遗传风险评估(需侧重胚系突变),还是用于指导当前肿瘤治疗方案(需同时关注体系突变和基因组瘢痕)。
  • 关注检测范围:理想的HRD检测应涵盖BRCA1/2及其他相关的HRR通路基因(如PALB2, RAD51C/D, ATM等),并包含基因组不稳定性评分分析。
  • 了解技术平台:确认检测机构使用的是经过临床验证的、可靠的NGS平台与生物信息学分析流程。
  • 考察报告解读:报告应提供清晰、准确的突变分类(致病性、疑似致病性等)、HRD状态判定(阳性/阴性)以及明确的临床意义解读和治疗建议提示。
  • 考虑样本情况:根据可获得的样本类型(新鲜组织、存档蜡块、血液)选择相应的检测套餐。

5. 预防与监测建议

对于已检出HRD相关胚系致病突变的高危人群及患者,除针对性治疗外,还需关注以下方面:

  • 遗传咨询与家系验证:胚系突变携带者应接受专业的遗传咨询,其直系亲属可考虑进行验证性检测,以便进行早期风险评估和管理。
  • 增强癌症筛查:例如,BRCA1/2突变携带女性,建议从更早年龄开始,或增加乳腺癌(乳腺MRI联合钼靶)、卵巢癌的筛查频率。
  • 预防性手术考量:对于极高风险个体,在经过充分评估和咨询后,可考虑预防性乳腺/卵巢输卵管切除术,这已被证明能显著降低相关癌症风险。
  • 治疗后的监测:HRD阳性的肿瘤患者,在接受PARP抑制剂等靶向治疗期间及治疗后,应遵医嘱进行定期影像学及肿瘤标志物监测,评估疗效及管理潜在副作用。
  • 健康生活方式:保持健康体重、规律运动、均衡饮食,避免吸烟、过量饮酒等,是普遍的癌症风险控制措施。

6. 检测须知

  • 产品信息:本产品为肿瘤同源重组缺陷(HRD)检测,属于肿瘤基因检测下的BRCA/HRD子类。
  • 检测方法:采用新一代测序技术。
  • 样本要求:适用于组织样本(手术或活检获取的肿瘤组织)或血液样本(用于胚系分析)。具体样本采集、保存及运输需遵循检测机构提供的指南。
  • 报告周期:自实验室确认收到合格样本之日起,约需7个工作日出具检测报告。
  • 结果解读:检测报告为专业的医学资料,所有结果必须由临床医生结合患者的具体病情、病史及其他检查结果进行综合解读,并做出治疗决策。
  • 局限性说明:任何技术均有其检测局限性,可能存在罕见变异类型未被覆盖或结果不明确的情况。阴性结果不能完全排除HRD状态或其他遗传风险的存在。
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