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病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)

安丘市万核医学基因检测咨询中心是潍坊市安丘市专业病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)预约机构,位于东省潍坊市安丘市景芝镇淮安路377号(如需办理,需提前预约),预约电话4001789498。为潍城区、寒亭区、等地患者提供精准病原微生物检测服务。

预约价 ¥5200
¥6760
省¥1560
报告时间:3-5个工作日
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检测项目详情

在临床抗感染实践中,我们常常面临这样的困境:高热不退,感染指标持续攀升,但传统学结果却反复阴性;,在经验性抗感染治疗的覆盖下,依然进展,我们不禁要问,是否遗漏了罕见体?是否存在现有方案无法的耐药机制?重症监护(ICU)或抑制中,快速、精准地锁定“凶”并明确耐药特征,是挽救生命、改善预后的。微生物宏基因组检测(DNA+RNA)正是为破解这些临床难题而生的新一代分子诊断利器。

一、 项目介绍:从传统局限到技术突破

安丘市万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)检测服务。预约电话:400-178-9498

传统的学诊断方法,如涂片镜检、、抗原抗体检测等,存在周期长、阳性率低、通量有限、难以覆盖非及罕见体等固有局限。当面对危重、不明的感染时,这些局限性往往导致诊断延迟和治疗被动。

微生物宏基因组检测(mNGS)技术实现了革命性突破。它无需预设,通过对临床样本中微生物(细菌、、真菌、寄生虫)的DNA和RNA进行高通量测序,与海量体数据库进行比对,可在一次检测中实现广谱、无偏倚的体筛查与鉴定。同时,该技术还能同步检测与耐药和毒力基因,为精准抗感染治疗提供分子依据。

中国感染与挑战:我国是结核高国家,数量第三。医院感染,特别是ICU感染发生率高达15%-30%,严重威胁。细菌耐药形势严峻,碳青霉烯类耐药革阴性杆菌(CRO)等多重耐药菌的检出率逐年增长。社区获得性肺炎不下,而脓毒症作为感染最严重的并发症,死亡率仍然较高。这些严峻的现实,对学的快速精准诊断提出了前所未有的迫切需求。

二、 检测:覆盖,精准锁定

本检测项目基于二代测序平台,构建了、经过严格质控的微生物数据库,确保检测结果的临床。

检测类别 体类型 覆盖数量 特点
体鉴定 细菌(需氧、厌氧、胞菌等)、(DNA与RNA)、真菌(菌、丝状真菌、肺孢子菌等)、原生生物(寄生虫等) 31033种 一次检测覆盖临床常见、罕见及新原体,诊断困难或传统方法无法检测的。
耐药基因检测 β-、碳青霉烯、糖肽类、大环类、喹诺类等主要抗生素类别抗性基因 4417种 从基因层面提示耐药可能性,判断耐药表型,指导抗生素选择与升级。
毒力基因检测 与体侵袭、定植、逃逸、毒素产生等基因 484种 评估体潜在力强弱,判断感染严重程度与预后。

性能说明:检测的灵敏度与特异度受样本类型、体载量、人源背景浓度等多种因素影响。对于无菌部位样本(如脑脊液、血液),诊断特异性极高;对于呼吸道样本等有菌部位,通过严格的生信分析阈值和背景菌群过滤,可有效鉴别菌与定植菌/环境菌。

三、 技术原理:从样本到报告的标准化流程

检测流程严格遵循实验室质量管理体系,确保结果准确可靠:

  • 样本处理与提取:根据不同样本类型(如痰液、血液、组织)进行前处理,同步提取总(DNA与RNA)。
  • 文库构建:RNA经逆转录为cDNA后,与DNA一同进行片段化、加接头等步骤,构建适用于测序的文库。
  • 高通量测序:在二代测序平台上进行大规模平行测序,生成海量序列读长。
  • 生物信息学分析:这是核心技术环节。去除人源序列,然后将剩余的序列与专用微生物数据库进行比对、注释和分类。通过一系列算法过滤背景噪音,计算体的序列数、相对丰度等指标,并分析耐药基因与毒力基因。
  • 报告生成:结合生信分析结果与临床信息,生成结构化报告,列出可疑微生物丰度信息、检出的耐药与毒力基因。

四、 适用人群与临床场景

本检测适用于以下存在诊断困境或需要快速精准指导治疗的感染:

  • 危重症感染:ICU中患有重症肺炎、脓毒症、脓毒性、中枢神经系统感染等,危急且不明。
  • 不明原因发热/炎症综合征:长期发热,经初步检查未能明确感染灶及体。
  • 缺陷或抑制:如器官移植后、肿瘤化疗后、长期使用抑制剂、HIV等,感染体复杂、不,进展。
  • 经验性抗感染治疗失败:根据经验用药后,临床反应不佳,感染指标无改善或持续恶化,需重新评估与耐药。
  • 特殊或罕见部位感染:如骨感染、感染性心膜炎、深部组织脓肿等,常规取材困难或阳性率低。

五、 样本采集、保存与送检规范

合格的样本是保证检测质量的前提。请以下规范操作:

样本类型 采集量要求 保存与运输 注意事项
静脉血 建议使用专用游离DNA采血管,采集规定体积。 室温运输,尽快送检。冷冻血。 尽量在抗菌药物使用前采集。溶血。
痰液/肺泡灌洗液 痰液需为深部咳出的合格痰;BALF收集规定体积。 置于无菌螺旋盖痰杯中,2-8℃保存并立即送检。 口咽部正常菌群污染。BALF诊断价值通常高于痰液。
脑脊液/胸水 尽可能多采集,通常不少于1毫升。 置于无菌容器,2-8℃保存,立即送检。 严格无菌操作。对于疑似性脑炎,脑脊液是首选样本。
组织 绿豆至黄豆大小,置于无菌生理盐水湿润的纱布中。 置于无菌冻存管,2-8℃保存并快速送检。 选择与正常组织交界处。福尔马林固定。
拭子 用力在感染部位旋转涂抹获取足量细胞。 使用专用转运或运送,2-8℃保存。 干拭子送检。注明取材部位。

通用原则:所有样本应尽快送检,若运输时间可能规定时限,请咨询实验室。申请单详细填写临床信息(如症状、体征、影像学发现、已用抗菌药物等),这对结果解读。

、 在抗感染治疗监测中的应用

mNGS可用于初始诊断,也可作为治疗监测:

  • 疗效评估时机:对于初始mNGS阳性的重症,在启动或调整针对性抗感染治疗一段时间后(通常为5-7天),若临床反应不佳,可考虑复查mNGS,以评估体或发现新的继发/混合感染。
  • 复检指征:临床症状或感染指标再次加重;出现新的感染灶;状态发生重大变化(如粒细胞恢复期)。
  • 耐药监测:治疗过程中,若耐药基因的检出丰度发生显著变化,可能提示耐药菌株的选择性增殖,需警惕治疗失败风险。

注意:检测结果需结合临床综合判断。体的可能滞后于临床改善,定植菌也可能持续存在,因此不推荐常规进行频繁复查。

七、 报告解读要点与临床决策

解读mNGS报告是一项需要临床思维与微生物知识结合的工作:

  • 理解“阳性”阈值:报告会根据体的序列数、基因组覆盖度、相对丰度等设定阈值。达到报告标准的体列为“可疑微生物”。但“检出”不等于“”,紧密结合临床表现、样本类型和本地学进行判断。
  • 鉴别混合感染与背景菌:呼吸道、肠道等有菌部位样本中,常会检出多种微生物。需区分是真正的混合感染、优势菌伴定植,还是单纯的背景菌群。高序列数、高丰度且与临床表现高度吻合的体临床意义更大。
  • 理性耐药基因:耐药基因的检出提示存在耐药机制的可能性,但不能等同于临床耐药表型。基因型需与药敏试验结果(如有)相互印证。某些耐药基因可能存在于非菌中,需结合体鉴定结果分析。
  • 综合分析决策:最终的诊断和治疗决策,应基于mNGS结果、传统微生物学结果、影像学、学及临床信息,由临床医生综合判断后做出。mNGS是强大的,而非替代临床思维的“金标准”。

本检测报告周期为24-48小时,为急危重症感染的快速诊断提供了宝贵的时间窗口。通过将这项技术整合到临床诊疗路径中,我们有望显著提升疑难、危重感染的诊治水平,遏制抗菌药物不合理使用,最终改善预后,应对日益严峻的感染挑战。

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