微生物宏基因组测序数据分析

项目介绍

微生物宏基因组测序（mNGS）数据分析是一项基于高通量测序技术的生物信息学分析服务。它通过对样本（如组织或血液）中微生物的DNA和/或RNA进行无偏倚测序，利用专业的生物信息学流程，一次性检测细菌、、真菌、寄生虫等多种体，为复杂、疑难、危重或新发突发感染诊断提供依据。

感染性的重大挑战。在中国，感染性尤为沉重：结核数第三，是严重的问题；重症监护（ICU）的医院感染发生率高达15%至30%，显著延长住院时间并增加死亡率；临床耐药菌的检出率呈持续增长态势，给抗感染治疗带来严峻考验；社区获得性肺炎不下，是常见的感染之一；脓毒症凶险，死亡率高，早期明确体是改善预后的。在此背景下，传统微生物检测方法（如、涂片、PCR）耗时长、通量低、覆盖有限或依赖验假设等局限性，难以满足快速精准诊断的需求。mNGS技术应运而生，数据分析环节则是将海量测序数据转化为临床可解读信息的核心步骤。

感染诊断决策路径

在临床抗感染实践中，诊断路径的优化直接治疗成败与预后。传统的“经验性用药--针对性治疗”模式在面对复杂感染时往往周期长、阳性率低。mNGS数据分析的，构建了更为高效精准的现代感染诊断决策路径。

该路径强调mNGS并非替代传统方法，而是作为强有力的和升级，传统方法阴性或时效性不足时，能够快速缩小诊断范围，指导抗生素的合理降阶梯或靶向升级，从而遏制抗生素滥用，改善预后。

体覆盖范围

本数据分析服务基于微生物数据库与优化的生信分析流程，广泛的体检测能力。

检测与分析流程

从样本到报告，mNGS数据分析是一个严谨、标准化的过程：

1. 样本接收与质检：接收符合要求的组织或血液样本，进行质量评估。
2. 文库构建与测序：对提取的总进行建库，并在高通量测序平台上进行测序，产生原始数据。
3. 生物信息学分析（核心）：
   • 数据质控与去宿主：过滤低质量序列，并尽可能去除人源背景序列，富集微生物数据。
   • 序列比对与注释：将序列与综合微生物数据库进行比对，鉴定微生物种类。
   • 丰度计算与阈值判断：通过统计学模型计算各体的序列数丰度，结合背景数据库设定阈值，区分背景噪音与真实感染信号。
   • 耐药与毒力分析：比对耐药基因数据库，提示潜在的耐药表型。
4. 报告生成与解读：将分析结果整合成结构化报告，列出疑似体、序列数、相对丰度、覆盖度等指标，并附上初步的临床解读建议。

在抗感染监测中的应用价值

本数据分析服务在临床抗感染多环节中扮演着重要角色：

• 早期快速诊断：对于危重脓毒症、脑膜炎、重症肺炎等，可在（报告周期48小时）提供潜在的体，为治疗赢得时间。
• 疑难感染溯源：对于发热查、传统方法反复阴性、抑制宿主合并的复杂感染，能进行无偏倚筛查，发现罕见或混合体。
• 指导抗生素管理：通过体鉴定和耐药基因提示，帮助临床医生实现从广谱经验治疗向窄谱精准治疗的“降阶梯”，或及时调整无效方案，有助于遏制耐药菌产生。
• 新发突发预警：无预设性的特点，能够检测未知或新原体，在中前瞻性价值。
• 疗效监测：动态监测治疗前后样本中体序列丰度的变化，可作为评估治疗效果的指标。

送检须知

• 适用人群：适用于疑似严重、复杂、难治性、混合性或新发突发体感染的住院，缺陷、危重症以及经传统检测未能明确。
• 样本要求：
  • 血液：建议使用专用游离DNA采血管，采血规范操作。
  • 组织：无菌操作获取，置于无菌无菌保存管中。
  • 采集量、运输条件及保存温度请遵循检测机构的详细指南，以确保样本质量。
• 报告解读：mNGS数据分析报告是重要的临床参考，但结合临床表现、影像学结果、实验室检查及学史进行综合判断。报告中检出的微生物需区分是菌、定植菌还是环境背景。阴性结果不能排除感染。
• 局限性：该技术可能受样本中体载量、提取效率、宿主背景干扰、数据库完整性以及生信分析阈值设定等因素影响。对RNA检测需特定的RNA建库流程。

本产品介绍旨在说明微生物宏基因组测序数据分析服务的原理、流程与应用价值。检测服务应由资质的医疗机构或实验室提供，临床决策请遵从执业医师的专业判断。

* 以上价格仅供参考，实际价格以机构为准

预约流程

1. 在线预约：通过本平台预约，客服会在1小时内与您联系确认。

2. 到院采样：按预约时间前往机构，由专业人员采集样本。

3. 等待结果：样本送检后3-5个工作日出具检测报告。

4. 获取报告：支持自取、快递、电子邮件等多种方式。

注意事项

1. 提前预约：请至少提前1天预约，以便安排检测时间。

2. 携带证件：请携带本人有效身份证件。

3. 退改政策：未采样前支持随时退款；如需改期请提前联系客服。