病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)
在毕节市七星关区做病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA),推荐毕节市万核医学基因检测咨询中心(毕节市七星关区文化路52号(如需办理,需提前预约)),电话4001789498。专业病原检测,助力感染性疾病精准诊疗。
微生物宏基因组检测(DNA+RNA)项目介绍
产品名称:微生物宏基因组检测(DNA+RNA)
所属分类:感染检测
产品子类:宏基因组项目
检测方法:二代测序技术
报告周期:24-48小时
感染现状与挑战
在毕节市七星关区做病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA),推荐毕节市万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物宏基因组检测(DNA+RNA)检测服务。预约电话:400-178-9498
感染的主要威胁之一。在中国,感染性尤为沉重。数据显示,中国结核数量第三,是结核高国家之一。在重症监护室(ICU)中,医院获得性感染的发生率高达15%至30%,显著增加了率、住院时间和医疗成本。同时,细菌耐药形势严峻,临床分离菌株中耐药菌的检出率呈持续增长态势,给抗感染治疗带来巨大挑战。
社区获得性肺炎作为常见的感染,不下,是导致就医和死亡的重要原因。更为严重的是,脓毒症作为感染导致的炎症反应综合征,死亡率极高,快速、准确地明确体是改善预后的。传统的体检测方法,如涂片镜检、和抗原抗体检测,存在周期长、阳性率低、覆盖窄等局限性,难以满足危重、疑难及新发突发传染快速诊断需求。
微生物宏基因组检测(DNA+RNA)正是为了解决上述临床痛点而发展起来的前沿技术。它通过对临床样本中微生物(细菌、、真菌、寄生虫)的DNA和RNA进行高通量测序,无需预设,即可一次性完成海量体的鉴定。本检测可覆盖31033种微生物,同时还能检测4417种抗性基因以及484种毒力基因,为临床提供“体鉴定-耐药性预测-毒力评估”的一体化解决方案,精准指导抗感染用药。
适用样本类型
- 静脉血
- 痰液
- 肺泡灌洗液
- 脑脊液
- 水
- 积液
- 拭子(如咽拭子、伤口拭子等)
- 实体组织
- 粪便
临床应用:用于确定感染微生物、确定抗性基因、评估毒力基因表达水平、指导抗生素精准用药。
感染诊断决策路径
传统的感染诊断路径往往从经验性用药开始,存在一定的盲目性。随着检测技术的发展,诊断决策正朝着更精准、更快速的方向演进。下图展示了从经验治疗到精准治疗的现代感染诊断决策流程:
感染诊断决策演进
微生物宏基因组检测(mNGS)是实现从经验性治疗向精准治疗跨越技术桥梁。
体覆盖范围
本检测基于庞大的微生物基因组数据库,实现了对临床体的覆盖。通过同时检测DNA和RNA,确保了DNA、RNA、细菌、真菌、寄生虫等各类体均能被有效捕获,应对新发、罕见及混合感染。
覆盖范围概览
此外,检测还整合了4417种抗性基因数据库,可预测细菌、真菌的耐药表型,为抗生素选择提供分子依据;同时分析484种毒力基因,有助于评估体的潜力。
检测流程
- 样本采集与运送:由临床医生根据疑似感染部位,规范采集相应样本(如血液、肺泡灌洗液、脑脊液等),使用专用采样管,低温快速运送至检测实验室。
- 提取:对样本进行前处理,同步提取样本中所有微生物的总DNA和总RNA。
- 文库构建与测序:将提取的构建成适用于二代测序的文库,在高通量测序仪上进行大规模平行测序。
- 生物信息学分析:将产生的海量序列数据与微生物基因组数据库、抗性基因数据库、毒力基因数据库进行比对、注释和统计分析,去除人源及背景干扰。
- 报告:结合测序数据深度、微生物序列数、临床意义等因素进行综合判读,在24-48可疑体列表、相对丰度、耐药基因与毒力基因信息的临床报告。
在抗感染监测与管理中的应用价值
- 危重症感染的快速诊断:对于脓毒症、重症肺炎、中枢神经系统感染等危重,可快速(24-48小时)明确,缩短诊断时间,为抢救生命赢得窗口。
- 疑难与特殊感染诊断:对于传统方法反复阴性、缺陷宿主感染、发热、新发突发等疑难,提供无偏性的筛查方案。
- 抗生素管理:通过明确体及耐药基因,促进抗生素的精准、降阶梯或靶向使用,减少广谱抗生素的滥用,符合国家抗菌药物科学化管理(AMS)要求。
- 医院感染控制:可快速识别医院感染暴发或聚集性的体,并进行同源性分析,为追溯感染源、切断传播链提供分子学证据。
- 治疗监测:动态监测治疗过程中体载量的变化,评估疗效。
送检须知
样本采集要求
- 请根据临床疑似感染部位,选择代表性的样本类型送检(如肺部感染送检肺泡灌洗液或深部痰液,中枢感染送检脑脊液)。
- 严格无菌操作,污染。血液样本建议在寒战、发热初期或使用抗生素前采集。
- 使用实验室提供的专用无菌容器或保存管采集样本,并确保密封良好。
样本储存与运输
- 样本采集后应尽快送检。如不能立即送检,请根据样本类型置于2-8℃(如血液、脑脊液)或-20℃(如组织)临时保存。
- 运输过程中需使用生物袋,并足量冰袋或干冰保持低温,防止降解。
申请单填写
- 请完整填写送检申请单,提供详细的临床信息,基本信息、主要症状体征、疑似诊断、时间、已用抗菌药物、基础、状态、史、学史等,这对结果的准确判读。
报告解读
- 检测结果需由临床医生结合临床表现、影像学、实验室检查结果进行综合判读。
- 报告中体的序列数、相对丰度、覆盖度等指标可作为判断临床性的参考,但并非诊断感染的唯一标准。定植、污染、背景微生物等因素需被排除。
- 耐药基因的检出提示存在耐药的可能性,但可能与表型耐药一致,临床用药仍需评估。
