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病原微生物(DNA+RNA)

石阡县万核医学基因检测咨询中心是铜仁市石阡县专业病原微生物(DNA+RNA)预约机构,位于贵州省铜仁市石阡县汤山镇长征北路44号(如需办理,需提前预约),预约电话4001789498。为碧江区、万山区等地患者提供精准病原微生物检测服务。

预约价 ¥3900
¥5070
省¥1170
报告时间:3-5个工作日
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检测项目详情

直面中国感染病严峻挑战:精准诊疗的迫切需求

石阡县万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物(DNA+RNA)检测服务。预约电话:400-178-9498

在中国,感染性疾病的诊疗正面临前所未有的复杂局面与严峻挑战。重症监护病房(ICU)的医院获得性感染率高达15-30%,严重威胁重症患者的生命安全。细菌耐药形势尤为紧迫,临床分离菌的耐药检出率持续增长,多重耐药菌与泛耐药菌的流行使得传统经验性抗感染治疗频频失效。社区获得性肺炎发病率居高不下,而脓毒症作为感染最严重的并发症,其死亡率依然沉重。此外,中国作为全球结核病高负担国家之一,患者数量位居全球第三,结核病及耐药结核病的诊断与控制任务艰巨。在此背景下,快速、全面、精准地明确病原体,是打破诊疗僵局、改善患者预后的关键所在。

1. 项目介绍:传统局限、技术突破与中国感染数据

传统病原学检测方法,如涂片镜检、培养、抗原抗体检测及靶向PCR,存在周期长、灵敏度有限、通量低及病原体覆盖范围窄等固有局限。面对混合感染、罕见病原体或已接受抗菌药物治疗的样本时,其检出能力显著下降,常导致临床诊断延误或漏诊。

病原微生物宏基因组测序(mNGS)技术代表了感染病原诊断领域的革命性突破。本产品“病原微生物(DNA+RNA)”检测,采用新一代测序(NGS)技术,无需预设,一次性对临床样本中所有微生物(包括细菌、真菌、病毒、寄生虫等)的DNA和RNA遗传物质进行高通量测序,通过与专用数据库比对,可在短时间内(报告周期为7个工作日)实现病原体的快速鉴定。该技术尤其适用于应对中国当前复杂的感染病流行病学现状:高发的ICU院内感染、不断增长的耐药菌株、庞大的结核病群体以及病因复杂的社区获得性肺炎和脓毒症病例,为临床提供了一种不受传统培养限制的、无偏倚的病原体筛查强大工具。

2. 检测内容

检测维度 具体内容 技术性能特点
病原体类型 细菌、真菌(包括耶氏肺孢子菌)、病毒、寄生虫、结核分枝杆菌复合群、非结核分枝杆菌等。 覆盖范围广,兼顾典型与非典型、常见与罕见病原。
检测数量 可同时检测数万种微生物序列。 高通量,一次实验解决多病原筛查问题。
灵敏度 针对不同病原体和样本类型,具有较高的检测灵敏度,尤其对难以培养或已使用抗生素后的病原体。 远高于传统培养法,对低载量病原体有较好提示作用。
特异度 通过严格的生信过滤与人源背景降噪,结合数据库特异性比对,保证结果的可靠性。 有效区分背景噪音、定植菌与真实致病菌。

3. 技术原理与流程

本检测基于NGS技术,流程严谨,旨在从复杂临床样本中最大化获取病原体信息:

  • 样本处理与核酸提取:对送检的体液(如肺泡灌洗液、脑脊液、胸腹水等)或外周血样本进行前处理,同步高效提取样本中所有微生物的总核酸(DNA与RNA)。
  • 文库构建:将提取的核酸进行片段化、末端修复、接头连接等步骤,构建适用于测序仪的测序文库。RNA病原体需经过逆转录步骤。
  • 高通量测序:将构建好的文库在高端测序平台上进行大规模并行测序,生成海量的序列读长。
  • 生物信息学分析:此为技术核心。对下机数据进行质控,去除人源宿主序列,将剩余的微生物序列与经过严格校验的病原微生物基因组数据库进行比对、注释与分类学分析,最终生成病原体列表。

4. 适用人群

本检测主要适用于以下存在明确临床需求的患者群体:

  • ICU重症感染患者:尤其是呼吸机相关性肺炎、血流感染、导管相关感染等病情危重、进展迅速,急需明确病原以指导治疗者。
  • 原因不明的发热/感染性疾病患者:经传统检查未能明确病原,病情迁延不愈或诊断存疑。
  • 免疫低下宿主:如血液肿瘤、器官移植、HIV感染、长期使用免疫抑制剂等患者,其感染病原体谱特殊,易发生机会性感染。
  • 经验性抗感染治疗失败患者:初始治疗方案无效或病情反复,需寻找未被覆盖的病原体或耐药可能。
  • 特殊部位或特殊类型感染:如中枢神经系统感染、侵袭性真菌感染、骨关节感染等,传统方法取材困难或阳性率低。

5. 样本采集与送检规范

规范的样本采集与运输是保证检测准确性的首要环节。

  • 样本类型:首选感染部位的无菌体液(如肺泡灌洗液、脑脊液、胸腹水、关节液等),其临床意义最大。外周血适用于血流感染、全身性感染或无法获取局部标本时。
  • 采集规范:必须严格遵守无菌操作原则,使用无菌容器。避免污染。采集量需达到最低要求以确保核酸提取量。
  • 保存与运输:采集后应立即送检。如不能立即送检,应按照不同样本类型的要求,置于专用保存管中,低温(通常建议2-8°C)保存与运输,以防止核酸降解和微生物增殖。严禁冷冻未经处理的某些体液样本。

6. 抗感染治疗监测中的应用

mNGS不仅用于诊断,亦可作为治疗监测的有力工具。

  • 疗效评估时机:对于重症或复杂感染,在启动或调整针对性抗感染治疗一段时间后(如5-7天),可考虑复查mNGS,动态观察病原体序列数的变化,辅助评估治疗反应。
  • 复检指征:患者临床症状体征无改善或恶化;降钙素原、C反应蛋白等感染标志物持续不降或反弹;需要评估感染是否清除,尤其是免疫抑制患者。
  • 耐药监测:部分mNGS检测可同时捕获与耐药相关的基因序列信息(如mecA、blaKPC、rpoB基因突变等),为临床怀疑耐药但表型药敏结果未出或无法获得时,提供重要的分子药敏线索。

7. 报告解读要点

正确解读mNGS报告是将其转化为有效临床决策的关键,需结合患者具体病情进行综合判断。

  • 阳性阈值(序列数)的解读:报告中病原体的序列数(Reads数)或相对丰度是重要参考,但并非绝对诊断标准。需区分高序列数(可能为优势致病菌)与低序列数(可能为背景、定植、污染或早期感染)。需结合样本类型(无菌部位vs.有菌部位)、病原体种类(强致病菌vs.条件致病菌)和临床背景综合判断。
  • 混合感染的识别:mNGS能有效揭示传统方法难以发现的混合感染。报告中列出多种病原体时,需评估各自的致病可能性,区分主次,指导联合或序贯治疗。
  • 耐药基因报告的解读:若报告提示检出耐药基因,应视为重要的风险提示,但需了解其与表型耐药可能存在的差异(如基因突变是否导致高水平耐药、是否存在沉默基因)。建议与临床微生物室沟通,并作为调整治疗方案的重要参考依据,最终仍需以临床疗效和标准药敏结果为准。

总结而言,病原微生物(DNA+RNA)宏基因组检测以其全面、快速、精准的优势,正成为应对中国严峻感染形势、助力感染病精准诊疗的核心技术之一。它为临床医生提供了前所未有的病原视野,但本质上仍是一项高级别的实验室检查,其结果必须由临床医生在深厚的专业知识和具体的临床情境中加以诠释与应用,方能最大程度地造福患者,改善感染性疾病预后。

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