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病原微生物宏基因组测序数据分析

黄陵县万核医学基因检测咨询中心是延安市黄陵县专业病原微生物宏基因组测序数据分析预约机构,位于延安市黄陵县土德路69号(如需办理,需提前预约),预约电话4001789498。为宝塔区、安塞区、延长县等地患者提供精准病原微生物检测服务。

预约价 ¥4600
¥5750
省¥1150
报告时间:3-5个工作日
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检测项目详情

微生物宏基因组测序数据分析

所属分类:感染检测 | 产品子类:宏基因组项目 | 检测方法:生信分析 | 样本类型:组织/血液 | 临床应用:对宏基因组检测数据进行分析,获取报告数据 | 报告周期:48h

项目介绍

微生物宏基因组测序(mNGS)数据分析是一项基于高通量测序技术的生物信息学服务,旨在直接从临床样本(如组织或血液)中无偏倚地检测和鉴定所有潜在体(细菌、、真菌、寄生虫)。该技术不依赖于传统的微生物,能够快速、揭示感染,为复杂、危重或疑难感染提供诊断依据。

中国感染现状与挑战

黄陵县万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物宏基因组测序数据分析检测服务。预约电话:400-178-9498

感染在中国乃至仍然是重大的挑战。精准、快速的诊断是有效治疗和控制感染。

  • 结核沉重:中国结核高国家之一,数量世界前列,对快速鉴别诊断提出了更高要求。
  • 医院感染形势严峻:重症监护(ICU)的医院感染发生率处于较高水平,增加了死亡风险和医疗。
  • 耐药问题日益突出:临床分离菌株中,耐药菌的检出率呈增长趋势,导致经验性用药失败风险增加。
  • 社区获得性肺炎高发:作为常见感染,谱复杂,早期明确体对指导治疗。
  • 脓毒症死亡率高:脓毒症起急、进展快,每延迟一小时有效抗菌治疗,死亡率显著上升,亟需快速诊断手段。

在此背景下,基于mNGS的生信分析能够突破传统方法的局限,为应对上述挑战提供强有力的技术支撑。

感染诊断决策路径

传统的感染诊断路径往往步骤繁琐、耗时较长。mNGS技术的,优化了诊断流程,加速了精准治疗的实施。

感染诊断与治疗决策演进

阶段 主要方法 特点 局限性 后续决策
初始阶段 经验性用药 基于临床症状和学,快速启动治疗 存在用药不准确风险,可能加剧耐药 进一步检测结果以调整
传统检测 微生物、学、PCR等 体鉴定的金标准或常用方法 耗时长(数天至数周)、检出率有限、无法覆盖未知或难 根据和药敏结果调整用药
检测 宏基因组测序(mNGS) 无偏倚、广谱、快速检测所有序列 成本相对较高,需专业生信分析解读 获得谱信息,指导精准治疗
目标阶段 精准靶向治疗 依据明确的体耐药基因信息,选用最有效药物 依赖于快速准确的诊断报告 优化治疗方案,改善预后,减少广谱抗生素使用

该决策图展示了从经验性治疗到精准治疗的演进过程,mNGS起到了桥梁作用。

体覆盖范围

本分析项目依托庞大的基因组数据库和优化的生信分析流程,能够实现极为广泛的体检测覆盖。

细菌
数万种
细菌

数千种
真菌
数千种
真菌
寄生虫
数百种
寄生虫

覆盖说明:

  • 细菌:覆盖临床常见及罕见的革氏阳性菌、革氏阴性菌、厌氧菌、胞菌等,多种耐药基因检测。
  • 涵盖DNA和RNA,呼吸道、出血热、疱疹、肝炎等。
  • 真菌:菌、丝状真菌、肺孢子菌等,助力侵袭性真菌感染的诊断。 寄生虫:检测原虫、蠕虫等,适用于性、罕见或常规检测困难的寄生虫感染。

该技术诊断混合感染、罕见体感染、以及传统阴性但临床高度怀疑的感染。

检测与分析流程

从样本到报告,我们遵循严格、规范的分析流程,确保结果的准确性与时效性。

1. 样本接收与质检

核对样本信息,进行质量评估。

2. 文库构建与测序

提取总,构建测序文库,进行高通量测序。

3. 生物信息学分析

原始数据质控,去除人源序列,比对数据库。

4. 结果解读与报告

结合临床信息,解读体序列数、丰度等,生成最终报告。

整个流程标准化的操作与强大的生物信息学平台,保障在约定周期交付专业、易懂的分析报告。

在抗感染治疗与监测中的应用价值

本数据分析服务提供鉴定,更在整体抗感染策略中发挥多重价值:

  • 早期快速诊断:缩短诊断时间窗,为脓毒症等急重症感染争取宝贵治疗时间。
  • 发现混合与罕见感染:一次性揭示样本中所有潜在,漏诊。
  • 指导抗生素精准使用:通过鉴定体及耐药基因信息,为降阶梯治疗或目标治疗提供依据,有助于遏制抗生素滥用和耐药菌蔓延。
  • 疗效监测:对于治疗困难的感染,可动态监测治疗前后体载量的变化,评估疗效。
  • 学调查:分析体基因组特征,为医院或社区感染的暴发调查提供分子学线索。

送检须知

样本要求

  • 样本类型:血液、组织(如肺组织、淋巴结等)、无菌体液(如脑脊液、胸水)等。请详细的样本采集与运输指南。
  • 采集与运输:使用无菌容器采集,污染。建议使用专用的游离DNA保存管(用于血液)。采集后尽快低温运输。

信息提供

  • 请完整填写送检申请单,基本信息、主要临床症状、影像学发现、已用抗菌药物、临床初步诊断等。这些信息对于结果的准确解读。

报告解读

  • 报告将列出检测到的体相对丰度、序列数等指标。结果的临床意义需由医师结合综合判断。阴性结果不能排除感染。

如有任何样本采集、运输或报告解读的疑问,请联系技术支持。

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