多重病原靶向测序
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多重靶向测序
所属分类：感染检测 / 产品子类：靶向测序项目
检测方法：多重PCR+二代测序
样本类型：外周血；痰液；肺泡灌洗液；气道分泌物；咽喉拭子；脑脊液；胸水；水
报告周期：24-48小时
项目介绍
多重靶向测序是一项基于多重PCR扩增与高通量测序技术相结合的精准感染诊断方案。该技术通过特异性引物池，对临床样本中219种临床常见体（细菌、DNA、RNA、真菌和原生生物）的基因组靶标进行高效富集，并同步检测828种耐药基因及分型，实现一次检测即可获取微生物鉴定与耐药性信息。
核心优势在于了广度与深度：相较于传统方法，提升了体检出率与时效性；相较于宏基因组测序（mNGS），针对性的富集策略显著提高了目标的测序深度与检测灵敏度，并有效降低了宿主背景干扰与检测成本，为临床抗感染治疗提供快速、精准的决策依据。
中国感染现状与挑战
德格县万核医学基因检测咨询中心提供专业的多重病原靶向测序检测服务。预约电话：400-178-9498
感染性精准诊断面临严峻挑战，数据凸显了本检测的临床紧迫性：
- 结核沉重：中国是结核高国家之一，数量第三，对快速、准确的鉴定与耐药检测提出了极高要求。
- 医院感染率高：重症监护（ICU）的医院感染发生率在15%至30%之间，血流感染、呼吸机肺炎等是主要类型，构成复杂，耐药现象普遍。
- 耐药形势严峻：临床分离菌株中，碳青霉烯类耐药革阴性杆菌（如CRAB、CRPA、CRE）的检出率呈持续增长趋势，导致经验性用药失败风险增加。
- 社区获得性肺炎（CAP）高发：CAP是常见的感染，谱多样，细菌、非体及，快速明确体是优化治疗。
- 脓毒症死亡率高：脓毒症及脓毒性凶险，死亡率高，早期、准确地识别微生物及耐药基因，对于启动精准抗菌治疗、改善预后。
在此背景下，多重靶向测序凭借快速、、精准的特点，成为应对上述挑战的有力，助力感染性诊疗从经验模式迈向精准模式。
感染诊断决策路径
传统的感染诊断路径往往层级递进，耗时较长。多重靶向测序的，优化了这一决策流程，缩短了精准用药的时间。
该决策图表明，多重靶向测序可作为传统的有效或替代，危重、疑难、混合感染或疑似耐药菌感染，能更快地将诊疗导向精准用药阶段。
体与耐药基因覆盖范围
本检测项目构建了一个而聚焦的体与耐药基因数据库，覆盖临床常见、重要及新发突发的体。
体覆盖谱（总计219种）
耐药基因覆盖（828种基因及分型）
同步检测与细菌耐药密切基因，为抗生素选择提供分子层面的依据：
- β-类耐药基因：ESBLs (如CTX-M, TEM, SHV)、碳青霉烯基因（KPC, NDM, IMP, VIM, OXA-48-like等）、AmpC基因等。
- 糖肽类耐药基因：如vanA, vanB等，用于万古霉素耐药肠球菌（VRE）及金黄色葡萄球菌（VRSA）的检测。
- 大环类、林可类、链阳菌素类（MLS）耐药基因。
- 四环素类、氨基糖苷类、喹诺类、磺胺类、甲氧苄啶等常见抗菌药物的耐药基因。
- 分枝杆菌耐药基因：针对结核分枝杆菌，检测利福平、异烟肼等一线药物的耐药基因突变。
通过解读耐药基因信息，临床医生可以预判体对特定抗生素的潜在耐药性，从而优化初始治疗方案或调整现有方案。
检测流程
- 样本采集与运送：根据感染部位，规范采集相应样本（如外周血、肺泡灌洗液、脑脊液等），使用专用采样管，低温及时运送至检测实验室。
- 提取：对样本进行前处理，并行提取总DNA与RNA，确保不同类型的体均被有效捕获。
- 多重PCR扩增：使用设计的、针对219种体特异性靶标及828种耐药基因的引物池，对进行多重PCR扩增，实现目标序列的高效富集。
- 文库构建与测序：将扩增产物构建成适用于二代测序的文库，上机进行高通量测序。
- 生物信息学分析：对下机数据进行质控、序列比对，通过与专用体及耐药基因数据库进行比对，鉴定体种类并报告检出的耐药基因。
- 报告：生成易于解读的临床检测报告，检出的体列表（通常附有相对丰度或序列数）、检出的耐药基因、以及临床解读建议。整个流程可在24-48完成。
在抗感染监测与管理中的应用价值
- 快速明确感染：对于危重症感染（如脓毒症、重症肺炎、中枢神经系统感染），能快速（24-48h）提供可能的微生物线索，缩短诊断盲期。
- 指导抗生素精准使用：通过体鉴定和耐药基因信息，帮助临床医生选择或调整最有效的抗生素，实现“降阶梯”或“目标治疗”，减少广谱抗生素的滥用，延缓耐药产生。
- 检测混合感染与罕见：能够一次性检出细菌、、真菌等多种的混合感染，并能发现传统方法难以检测的罕见或苛体。
- 医院感染防控：快速鉴定耐药菌（如CRE、CRAB）携带的耐药基因，有助于及时实施隔离措施，追溯感染源，防止传播。
- 疗效评估与动态监测：在治疗过程中，可对特定样本进行复查，通过体序列数的变化，评估抗感染治疗的效果。
送检须知
- 适用人群：疑似急性、危重、疑难、复杂或耐药体感染的住院或门诊；经验性抗感染治疗无效或反复；抑制宿主合并感染。
- 样本选择：采集疑似感染部位的样本（如肺炎取肺泡灌洗液或深部痰，中枢感染取脑脊液，血流感染取外周血）。应尽可能在抗菌药物使用前采集，若已用药需在申请单上注明。
- 样本要求：
- 外周血：使用专用血样采集管，采集量需满足要求。
- 呼吸道样本（痰液、BALF、分泌物等）：唾液污染，BALF需无菌采集。
- 脑脊液、胸水、水：无菌操作采集，建议送检体积不少于规定量。
- 所有样本均需标记信息、样本类型及采集时间。
- 运输与保存：采集后应尽快低温（推荐2-8°C）运送至实验室。若需长时间运输，应实验室进行保存。
- 结果解读：检测结果需由临床医生结合临床表现、影像学检查、实验室指标等进行综合判断。报告中体的检出需区分菌、定植菌或背景菌，耐药基因的检出需结合体种类解读临床意义。
多重靶向测序是感染诊断领域的一项革新性技术，它将靶向富集的特异性与高通量测序的性相结合，为临床医生提供了快速、精准的诊断利器，有助于推动抗感染治疗的个体化与精准化，最终惠及广大。
