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病原微生物宏基因组检测(DNA)

临泉县万核医学基因检测咨询中心是阜阳市临泉县专业病原微生物宏基因组检测(DNA)预约机构,位于安徽省阜阳市临泉县城关镇光明路800号(如需办理,需提前预约),预约电话4001789498。为颍州区、颍东区等地患者提供精准病原微生物检测服务。

预约价 ¥3500
¥4550
省¥1050
报告时间:3-5个工作日
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检测项目详情

引言:直面临床抗感染诊疗的困境

临泉县万核医学基因检测咨询中心提供专业的病原微生物宏基因组检测(DNA)检测服务。预约电话:400-178-9498

在感染科的日常诊疗中,我们时常面临这样的困境:一位重症肺炎,经验性广谱抗生素治疗后仍持续恶化,但反复的痰、血结果却始终为阴性。,一位抑制持续高热,学检查如同“大海捞针”,经验用药的“毯式轰炸”可能无效,更会加剧菌群紊乱和耐药风险。传统微生物检测方法(如、涂片、靶向PCR)的局限性——周期长、阳性率低、体覆盖范围窄——在复杂、危重、疑难感染面前暴露无遗。与此同时,中国感染沉重:结核数第三,ICU感染率高达15-30%,细菌耐药检出率持续增长,社区获得性肺炎不下,脓毒症死亡率更是不容忽视。在此背景下,如何快速、精准地揭开体的“隐身衣”,实现抗感染的精准打击,成为解决的临床刚需。

一、 项目介绍:传统局限、技术突破与中国感染现状

传统检测的“盲区”与挑战

传统的学诊断高度依赖,但60%的临床体难以或周期过长。涂片镜检灵敏度低,而基于假设的靶向PCR则无法检测未知或罕见体。这种“盲人摸象”式的诊断模式,导致大量,重症感染,诊断不明、治疗被动的局面。

技术突破:微生物宏基因组检测(DNA)

微生物宏基因组检测(mNGS)是一项革命性的体检测技术。它无需假设,即可对临床样本中所有微生物的DNA进行高通量测序,通过与专用数据库进行比对分析,一次性完成细菌、DNA、真菌、寄生虫等多种体的鉴定,并同步检测耐药基因和毒力基因。核心优势在于“广谱”、“快速”和“精准”,能在24-48报告,极大缩短了学诊断的时间,为危重感染救治赢得宝贵窗口。

严峻的中国感染数据

  • 结核:中国是结核高国家,数量第三,耐多药结核诊治挑战巨大。
  • 感染压力:我国ICU的感染发生率在15%至30%之间,是导致住院时间延长、医疗费用增加和死亡率升高的重要因素。
  • 耐药菌流行:临床常见菌如碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌(CRE)、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)等的检出率呈增长趋势,治疗选择日益受限。
  • 社区获得性肺炎(CAP):高,谱复杂,非体占比增加,经验性治疗失败风险不容忽视。
  • 脓毒症高死亡率:脓毒症是感染导致死亡的主要原因,早期明确体并给予精准抗感染治疗是改善预后的。

这些数据凸显了在我国推广快速、精准诊断技术的紧迫性和。

二、 检测:覆盖广泛的体与基因信息

检测类别 涵盖体类型 检测数量 灵敏度与特异度特点
DNA微生物 细菌、DNA、真菌(如曲霉、隐球菌)、原生生物(如弓形虫)、支原体/衣原体、分枝杆菌等 覆盖数千种体 对难、罕见、新原体高检测能力;特异度高,通过序列比对可精确到种/属水平。
耐药基因 与β-类、喹诺类、糖肽类、大环类等抗生素耐药基因 覆盖数百个耐药基因 可快速提示潜在的耐药表型,用药决策。需结合微生物鉴定结果综合解读。
毒力基因 与体侵袭力、性基因 覆盖常见毒力因子基因 评估体的潜在能力强弱,有助于区分定植与感染,评估严重程度。

三、 技术原理:从样本到报告的标准化流程

本检测基于第二代高通量测序技术,流程严谨,确保结果准确可靠:

  1. 样本处理与提取:对送检的静脉血、肺泡灌洗液、脑脊液等样本进行前处理,高效提取样本中所有微生物及宿主的总DNA,并去除宿主背景干扰。
  2. 文库构建:将提取的DNA片段化,连接测序接头,构建可用于测序的DNA文库。
  3. 高通量测序:在测序仪上进行大规模平行测序,产生海量的序列读长。
  4. 生物信息学分析:这是技术的核心。过滤低质量序列和宿主来源序列,然后将剩余的微生物序列与经过严格质控的微生物基因组数据库进行比对、注释和分类学分析。同时,与耐药基因库、毒力基因库进行比对分析。
  5. 报告生成:综合生信分析结果、临床信息和阈值判断,生成体列表、序列数、相对丰度、耐药及毒力基因信息的临床报告。

四、 适用人群:精准定位临床需求场景

本检测适用于以下临床:

  • ICU重症感染:如脓毒症、脓毒性、呼吸机肺炎、血流感染等,危重需快速明确。
  • 不明原因发热/炎症综合征:经初步检查未能明确感染灶和体的长期发热。
  • 抑制宿主感染:如器官移植后、粒细胞缺乏、长期使用抑制剂、HIV感染等,感染体复杂、特殊且进展。
  • 经验性抗感染治疗失败:根据经验用药48-72小时后,临床反应不佳或持续进展。
  • 特殊或罕见部位感染:如中枢神经系统感染、骨感染、物感染、深部组织脓肿等,传统方法取材困难或阳性率低。

五、 样本采集与送检:规范是准确的前提

正确的样本采集、保存和运输是保证检测质量的第一步。请严格遵守以下规范:

样本类型 采集容器 最低要求 运输与保存 注意事项
静脉血(血浆) 专用游离DNA采血管 满足检测要求 室温运输,尽快送检。如无法及时送检,可暂存于2-8℃。 溶血。严格无菌操作。
肺泡灌洗液(BALF)/痰液 无菌螺旋盖痰杯或无菌容器 满足检测要求 2-8℃冷藏运输,尽快送检。 BALF于痰液。上呼吸道定植菌污染。
脑脊液 无菌螺旋盖管 满足检测要求 立即送检,室温或2-8℃运输。 穿刺无菌操作,污染。送检微生物室。
组织 无菌容器,加无菌生理盐水保湿 满足检测要求 立即送检,2-8℃运输。 取与正常组织交界处。福尔马林固定。
胸水、液等体液 无菌螺旋盖管 满足检测要求 室温或2-8℃运输,尽快送检。 尽量多采集,以提高检出率。

、 抗感染治疗监测:动态评估与精准调整

mNGS用于初始诊断,也可用于治疗过程的动态监测。

  • 疗效评估时机:对于重症或复杂感染,在启动或调整抗感染治疗方案后5-7天,可考虑复查mNGS,以评估体载量变化和治疗应答。
  • 复检指征:①初始治疗临床反应不佳;②一度好转后再次加重,怀疑新发感染或原有感染未控;③抑制需要长期监测感染状态。
  • 耐药监测:治疗过程中,若mNGS持续检出体且同时检测到新的耐药基因,提示可能出现获得性耐药,需及时调整治疗方案。但需注意,耐药基因的检出需结合体种类和临床表型综合判断。

七、 报告解读:结合临床的综合判断艺术

mNGS报告是强大的,解读紧密结合临床背景。

  • 阳性阈值判断:报告中会提供体的序列数、相对丰度等指标。解读时需区分菌、定植菌和背景菌。通常,高序列数、高相对丰度、在无菌部位检出的体临床意义更大。需解读低序列数结果,可能为背景噪音、定植或污染。
  • 混合感染识别:mNGS能展示样本中存在的多种微生物。需根据各自的序列丰度、已知性及临床,判断是单一主菌、菌还是合并定植。
  • 耐药基因解读:耐药基因的检出提示该体存在潜在的耐药机制,但不等同于临床治疗一定失败。需结合该体对特定药物的常规药敏、基因型-表型对应库以及临床治疗反应进行综合判断。例如,检测到mecA基因强烈提示金黄色葡萄球菌对甲氧西林耐药。

总结:微生物宏基因组检测(DNA)无偏倚、广谱、快速的特性,正在重塑感染性诊断路径。它是对传统方法的重要和有力,在中国当前严峻的感染与耐药形势下,为临床医生提供了前所未有的诊断利器。然而,它并非万能,结果的准确性和临床价值,始终依赖于规范的样本采集、严谨的生信分析以及最重要的——临床医生基于信息的审判断。

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