临床辨识度低 + 表型复杂多变
临床表现不典型 / 多系统受累 / 与多种综合症相似 → 难以缩小到具体基因或 Panel → 本检测全外显子广覆盖 + 生信分析 + ACMG 解读。
临床辨识度低 + 表型复杂多变 + 遗传异质性高 + 存在多种诊断可能的疾病 / 经单基因或 Panel 检测阴性需要全面诊断的患者 / 没有可供选择的临床指征的患者 / 罕见综合症怀疑 / 8,000+ 种已知单基因遗传病的诊断
我国约 20% 的人患有遗传病 · 单基因遗传病综合发病率高达 1/100 · 占出生缺陷 22.3%。但已知单基因遗传病 8,000+ 种 · 临床症状复杂 · 诊断困难 · 传统检测漏诊误诊风险。本检测WES 全外显子覆盖几乎所有已知致病基因,是疑难病例的终极诊断方案。
临床表现不典型 / 多系统受累 / 与多种综合症相似 → 难以缩小到具体基因或 Panel → 本检测全外显子广覆盖 + 生信分析 + ACMG 解读。
已做单基因 Sanger / 病种 Panel 检测但阴性 + 临床高度疑似遗传病 → 本检测全外显子覆盖 + 可发现意外致病基因(broadening diagnosis)。
表型复杂无法明确指向某基因或某 Panel 病种(如多发畸形 / 智力障碍 + 多系统异常)→ 本检测无偏向覆盖所有蛋白编码区。
临床怀疑罕见综合征 / 综合征性遗传病(OMIM 列出综合征 6,000+ 种)→ 本检测覆盖大部分已知综合征致病基因。
核心家系模式(先证者 + 父母 3 人)显著优于 Solo 模式:① 家系共分离验证致病性;② 区分新生突变(de novo)/ 遗传突变;③ VOUS 重新分类。Trio 模式诊断率比 Solo 提升 20-30%。
明确单基因病(如囊性纤维化 CF / 多囊肾 PKD) → 用病种 Panel / 专项全外更聚焦经济;染色体异常 → 核型 / CNV-seq;大片段缺失重复 → MLPA 补充(WES 检 CNV 能力有限);药物基因组 → PGx 产品。
8,000+ 单基因病覆盖 + Solo/Trio 双模式 + Agilent/IDT 高质量平台 + 数据存储重分析。
遗传病现状:我国约 20% 的人患有遗传病;单基因遗传病单个发病率低但综合发病率高达 1/100;占出生缺陷 22.3%;已发现8,000+ 种(截至 2019 年 5 月已明确致病基因的有 5,370 种 / 已知基因 3,709 个)。本检测全外显子覆盖几乎所有已知致病基因(蛋白编码区 + 剪接位点 + 线粒体基因组)— 是疑难病例终极诊断方案。
2 种研究模式可选:① Solo 先证者模式:仅对先证者进行 WES + 生信过滤 + 先证者及父母 Sanger 验证;② Trio 核心家系模式(强烈推荐):对先证者 + 父母 3 人同时 WES + 家系共分离 + Sanger 验证。Trio 模式诊断率提升 20-30% — 通过家系共分离区分:① 新生突变 de novo(父母均阴性 + 先证者杂合)→ 强提示致病;② 遗传性突变(隐性 / 显性遗传)→ 验证遗传模式;③ VOUS(意义未明)→ 家系分离可重新分类。
国际通行高质量平台:Agilent SureSelect Human All Exon V6 或 IDT xGen Exome Research Panel v1.0(全球主流外显子捕获试剂盒)。严格技术参数:Q20 > 90%(碱基质量大于 20 占比 · 错误率 < 1%)+ Q30 > 85%(错误率 < 0.1%)+ 平均测序深度 ≥ 100 X(优于行业标准 50-80 X)+ 20× 覆盖度 94% 以上(高覆盖度减少漏检)。
本检测独特价值:产出数据存储与重分析服务。① 样本数据管理:长期保存测序原始数据 + 分析结果;② 随研究水平提高提供 WES 数据重分析:当新基因被发现 / 新致病变异被报道 / 数据库更新时,可对原数据重新分析而无需再次采血测序 — 初次阴性的患者将来仍有诊断机会。
本检测采用EDTA 抗凝外周血 ≥ 2 mL 或 DNA ≥ 3 μg。Trio 模式需先证者 + 父母 3 人样本。
| 项目 | P019 全外显子(通用版 · 本) | 病种专项全外 / Panel |
|---|---|---|
| 性质 | 通用 WES + 辅助临床研究 | 病种聚焦 + 临床指向 |
| 覆盖范围 | 全部蛋白编码基因 + 线粒体(8,000+ 已知病) | 聚焦特定病种基因(几十到几百) |
| 适合场景 | 临床辨识度低 / 表型复杂 / Panel 阴性 | 明确临床指向(CF/PKD/RP/眼科/共济失调等) |
| Solo / Trio 模式 | 支持 Trio 提升诊断率 20-30% | 通常仅 Solo |
| 诊断率 | Trio 模式 30-40%(疑难病例) | 病种相关患者通常 50-70% |
| 数据重分析 | 含 · 随研究水平提供数据重分析 | 通常不含 |
| 推荐路径 | 疑难病例终极诊断方案 | 明确临床指向首选(性价比高) |
本检测覆盖全部蛋白编码基因外显子区域 + 关键剪接位点 ± 20 bp + 线粒体基因组。已知单基因遗传病 8,000+ 种 · 5,370 种已明确致病基因。
Agilent SureSelect Human All Exon V6IDT xGen® Exome Research Panel v1.0
Q20 > 90%(碱基质量大于 20 占比 · 错误率 < 1%)Q30 > 85%(错误率 < 0.1%)平均测序深度 ≥ 100 X(高于行业标准 50-80 X)20× 覆盖度 94% 以上
Solo 先证者模式:仅先证者 WES + 父母 Sanger 验证Trio 核心家系模式:先证者 + 父母 3 人 WES + 共分离 + Sanger(诊断率提升 20-30%)
内含子深部变异 / UTR / 启动子区(需全基因组 WGS)大片段缺失/重复 CNV(需 MLPA / CNV-seq 配合)三联体扩增(需 PCR / 长读长)复杂重排 / 倒位 / 易位(需 Karyotype / OGM)线粒体异质性低于检测限的变异
本检测WES + 线粒体基因组 + Sanger 验证 + 双模式 Solo/Trio。局限性:① 不能检出内含子深部变异 / UTR / 启动子区(需 WGS);② 大片段缺失/重复识别有限(需 MLPA 配合);③ VOUS 不能直接作为决策(需家系分离 + 临床综合);④ 阴性结果不完全排除遗传病;⑤ 解读基于现有数据库 · 可能随更新变更。推荐 Trio 家系模式提高诊断率 20-30%。
全部蛋白编码基因外显子关键剪接位点 ± 20 bp线粒体基因组(mtDNA · ~16.5 kb)OMIM 5,370 种已明确致病基因已知单基因遗传病 8,000+ 种SNP + InDel 变异ACMG/AMP 致病性分级Sanger 测序验证Solo + Trio 双模式
国际通行捕获 + 高深度高覆盖 + Sanger 双重验证 + ACMG 标准解读。
| 质控指标 | 实测数值 | 行业基准 |
|---|---|---|
| 捕获平台 | Agilent SureSelect Human All Exon V6 或 IDT xGen Exome Research Panel v1.0 | 全球主流 |
| Q20 | > 90%(碱基质量 > 20 占比 · 错误率 < 1%) | 本产品高质控 |
| Q30 | > 85%(错误率 < 0.1%) | 本产品高质控 |
| 平均测序深度 | ≥ 100 X(高于行业标准 50-80 X) | 本产品独特 |
| 20× 覆盖度 | 94% 以上(≥ 20× 深度覆盖的外显子区域) | 本产品高质控 |
| 验证方法 | Sanger 测序金标准(关键变异双重保证) | 国际通行 |
| 致病性分级 | ACMG/AMP 2015 标准(Pathogenic / Likely Pathogenic / VOUS / Likely Benign / Benign) | 国际通行 |
报告内容严格按 MD 公版第七章 9 模块结构,涵盖测序质量 + 致病变异详解 + 家系咨询。
受检者基本情况 / 临床信息(家族史 / 表型 / 既往检测)
全外显子测序分析(Solo / Trio 模式标识)
Q20 / Q30 / 平均深度 / 20× 覆盖度
致病变异列表 + ACMG 分级(Pathogenic / Likely Pathogenic / VOUS)
单变异详情 + 关联疾病(OMIM)+ 遗传模式 + 文献(PMID)
关键变异的 Sanger 验证图(金标准 · 双重保证)
相关疾病的临床表现 + 预后 + 治疗
家系筛查 + 生育规划
WES 方法学 + 局限性
WES 多步骤 + 家系共分离 + Sanger 验证。
Day 0
医学顾问 1 对 1 沟通临床信息(表型 / 家族史 / 既往检测结果 / 是否疑难病例)+ 评估 Solo vs Trio 模式选择(强烈推荐 Trio),协助签订送检合同。
Day 0-1
EDTA 抗凝外周血 ≥ 2 mL(紫帽管)或 DNA ≥ 3 μg;Trio 模式同送先证者 + 父母 3 人样本;线下到店 / 上门采血 / 邮寄送样三选一。
Day 1-4
DNA 提取 → Agilent SureSelect / IDT xGen 外显子捕获 → 高通量测序(Q30 > 85% · 平均深度 ≥ 100X · 20× 覆盖 94%+)→ 同步线粒体测序。
Day 4-8
变异检出 → 数据过滤 → 致病性预测 → ACMG/AMP 分级;Trio 模式额外:家系共分离 / 新生突变识别 / 遗传模式分析。
Day 8-12
关键致病变异 Sanger 测序验证(金标准双重保证)→ 医学审核组双人复核 → 出具 PDF 报告(致病变异详解 + OMIM 关联疾病 + 遗传咨询)。
全球主流捕获平台 + ACMG/AMP 国际致病性分级 + OMIM 数据库 + 数据存储重分析服务。
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本检测适合疑难病例 / 临床辨识度低
Trio 模式诊断率提升 20-30%
WES 诊断率 30-40% · 不能完全诊断所有
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